More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_17860 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_17860  predicted protein  100 
 
 
253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.587324  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  60 
 
 
249 aa  297  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0512  electron transfer flavoprotein beta-subunit  58.43 
 
 
249 aa  293  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0864  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.43 
 
 
249 aa  292  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0174422  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1223  electron transfer flavoprotein beta-subunit  59.22 
 
 
249 aa  292  4e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal  0.15593 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4188  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.61 
 
 
249 aa  291  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2985  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  60 
 
 
249 aa  291  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26291  hitchhiker  0.000621115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0762  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.82 
 
 
249 aa  291  9e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  58.43 
 
 
249 aa  291  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.22 
 
 
249 aa  289  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3731  electron transfer flavoprotein beta-subunit  59.61 
 
 
249 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3012  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.61 
 
 
249 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2810  electron transfer flavoprotein beta-subunit  59.22 
 
 
249 aa  289  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194225  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3143  electron transfer flavoprotein beta-subunit  58.43 
 
 
249 aa  288  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2131  electron transfer flavoprotein beta-subunit  59.22 
 
 
249 aa  289  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0737  electron transfer flavoprotein beta-subunit  58.82 
 
 
267 aa  288  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0122378  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0998  electron transfer flavoprotein subunit beta  58.82 
 
 
249 aa  288  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740496  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0923  electron transfer flavoprotein subunit beta  58.04 
 
 
249 aa  288  7e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421451  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2268  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  60.39 
 
 
249 aa  288  7e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.074688  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0793  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.04 
 
 
249 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal  0.477243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1211  electron transfer flavoprotein subunit beta  58.82 
 
 
249 aa  287  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0421  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  60 
 
 
249 aa  287  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4829  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.65 
 
 
249 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  56.47 
 
 
249 aa  286  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0857  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.22 
 
 
249 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0411  electron transfer flavoprotein, beta subunit  57.65 
 
 
249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2550  electron transfer flavoprotein subunit beta  58.43 
 
 
249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2977  electron transfer flavoprotein, beta subunit  57.65 
 
 
249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2555  electron transfer flavoprotein, beta subunit  57.65 
 
 
249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0931  electron transfer flavoprotein, beta subunit  57.65 
 
 
249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1653  electron transfer flavoprotein, beta subunit  57.65 
 
 
249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2928  electron transfer flavoprotein, beta subunit  57.65 
 
 
249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2867  electron transfer flavoprotein, beta subunit  57.65 
 
 
249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101956  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0218  electron transfer flavoprotein, beta subunit  57.65 
 
 
249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1998  ATPase  59.22 
 
 
249 aa  285  4e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00163986  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7804  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.69 
 
 
446 aa  285  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1296  putative electron transfer flavoprotein (beta-subunit)  59.22 
 
 
249 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2639  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.65 
 
 
249 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1021  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.86 
 
 
249 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1062  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.86 
 
 
249 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3374  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.22 
 
 
249 aa  284  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2242  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.86 
 
 
249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438561  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5519  electron transfer flavoprotein subunit beta  58.82 
 
 
249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0460  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.08 
 
 
249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6870  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.22 
 
 
249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562162  normal  0.410167 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4175  electron transfer flavoprotein subunit beta  56.47 
 
 
249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00698848  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1957  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.47 
 
 
249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.41834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4166  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.47 
 
 
249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4880  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.08 
 
 
249 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7939  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.08 
 
 
249 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103189  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7298  electron transfer flavoprotein subunit beta  56.86 
 
 
249 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207608  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0942  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.08 
 
 
249 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85841  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0938  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.08 
 
 
249 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2168  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.65 
 
 
249 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0160278  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.47 
 
 
249 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.86 
 
 
249 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0583  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.47 
 
 
249 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3929  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2159  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.65 
 
 
249 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.86 
 
 
249 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2960  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.86 
 
 
249 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1402  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.82 
 
 
249 aa  279  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.881408  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1194  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.82 
 
 
249 aa  279  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2540  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.43 
 
 
249 aa  279  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3598  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.82 
 
 
249 aa  279  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0819  electron transfer flavoprotein subunit beta  55.29 
 
 
249 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2390  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.43 
 
 
249 aa  278  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.424195  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.29 
 
 
249 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4117  electron transfer flavoprotein subunit beta  56.47 
 
 
249 aa  278  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.838389  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4307  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.25 
 
 
249 aa  278  7e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0753  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.25 
 
 
251 aa  278  9e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2174  electron transfer flavoprotein subunit beta  56.47 
 
 
249 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5232  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.69 
 
 
249 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0937638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1140  electron transfer flavoprotein subunit beta  55.29 
 
 
249 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3687  electron transfer flavoprotein, beta subunit  55.29 
 
 
250 aa  275  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1608  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.04 
 
 
249 aa  275  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1290  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.47 
 
 
249 aa  275  5e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0308703  normal  0.0442598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2007  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.29 
 
 
249 aa  275  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760163  normal  0.289135 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.64 
 
 
249 aa  274  8e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921164  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2730  electron transfer flavoprotein subunit beta  56.08 
 
 
249 aa  274  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1989  Sigma 54 interacting domain protein  53.73 
 
 
251 aa  273  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1995  electron transfer flavoprotein subunit beta  55.29 
 
 
249 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184939  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15180  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.86 
 
 
249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3526  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.08 
 
 
249 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2185  electron transfer flavoprotein, beta subunit  55.29 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3236  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.51 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.654108 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2146  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.47 
 
 
271 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0676192  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1471  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.86 
 
 
249 aa  271  6e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00534232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14280  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.47 
 
 
256 aa  271  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577888  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2748  electron transfer flavoprotein beta-subunit  54.51 
 
 
249 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2584  electron transfer flavoprotein beta-subunit  53.73 
 
 
249 aa  270  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000331041  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2855  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.29 
 
 
249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4202  electron transfer flavoprotein, beta subunit  54.9 
 
 
249 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1651  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  54.9 
 
 
249 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2093  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.29 
 
 
249 aa  268  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3774  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.51 
 
 
249 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1169  electron transfer flavoprotein, beta subunit  54.12 
 
 
249 aa  268  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000191925  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1691  electron transfer flavoprotein subunit beta  54.47 
 
 
253 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0324  electron transfer flavoprotein beta-subunit  54.47 
 
 
253 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171629  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3271  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.8 
 
 
249 aa  268  8e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1971  electron transfer flavoprotein, beta subunit  54.55 
 
 
248 aa  267  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>