More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0957 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0925  electron transfer flavoprotein subunit beta  99.6 
 
 
249 aa  484  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0957  electron transfer flavoprotein subunit beta  100 
 
 
249 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321568  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0986  electron transfer flavoprotein subunit beta  99.6 
 
 
249 aa  484  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1006  electron transfer flavoprotein subunit beta  100 
 
 
249 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  59.44 
 
 
249 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0857  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.44 
 
 
249 aa  298  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2093  electron transfer flavoprotein beta-subunit  59.04 
 
 
249 aa  297  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3374  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.04 
 
 
249 aa  297  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3598  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.44 
 
 
249 aa  296  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1021  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.83 
 
 
249 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1062  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.83 
 
 
249 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0583  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.83 
 
 
249 aa  294  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3929  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0942  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.83 
 
 
249 aa  293  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85841  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0938  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.83 
 
 
249 aa  293  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2540  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.44 
 
 
249 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1194  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.44 
 
 
249 aa  293  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2242  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.83 
 
 
249 aa  292  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438561  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4188  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.23 
 
 
249 aa  292  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750076 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0512  electron transfer flavoprotein beta-subunit  58.63 
 
 
249 aa  291  5e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2810  electron transfer flavoprotein beta-subunit  58.23 
 
 
249 aa  291  7e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194225  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.23 
 
 
249 aa  291  7e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4175  electron transfer flavoprotein subunit beta  57.43 
 
 
249 aa  291  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00698848  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3731  electron transfer flavoprotein beta-subunit  58.23 
 
 
249 aa  290  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0998  electron transfer flavoprotein subunit beta  58.63 
 
 
249 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740496  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2390  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.23 
 
 
249 aa  290  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.424195  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4307  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.83 
 
 
249 aa  290  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3012  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.83 
 
 
249 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1402  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.23 
 
 
249 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.881408  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4166  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.43 
 
 
249 aa  289  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2168  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.43 
 
 
249 aa  288  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0160278  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1957  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.03 
 
 
249 aa  288  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.41834  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0793  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.03 
 
 
249 aa  288  7e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal  0.477243 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0762  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.83 
 
 
249 aa  288  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2985  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.83 
 
 
249 aa  288  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26291  hitchhiker  0.000621115 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1223  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.63 
 
 
249 aa  288  8e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal  0.15593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1296  putative electron transfer flavoprotein (beta-subunit)  57.83 
 
 
249 aa  287  9e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0737  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.02 
 
 
267 aa  287  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0122378  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0411  electron transfer flavoprotein, beta subunit  56.63 
 
 
249 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2550  electron transfer flavoprotein subunit beta  56.22 
 
 
249 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2977  electron transfer flavoprotein, beta subunit  56.63 
 
 
249 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2639  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.03 
 
 
249 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0218  electron transfer flavoprotein, beta subunit  56.63 
 
 
249 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1653  electron transfer flavoprotein, beta subunit  56.63 
 
 
249 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2555  electron transfer flavoprotein, beta subunit  56.63 
 
 
249 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2867  electron transfer flavoprotein, beta subunit  56.63 
 
 
249 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101956  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2928  electron transfer flavoprotein, beta subunit  56.63 
 
 
249 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0931  electron transfer flavoprotein, beta subunit  56.63 
 
 
249 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4829  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.03 
 
 
249 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7298  electron transfer flavoprotein subunit beta  56.22 
 
 
249 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207608  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.42 
 
 
249 aa  286  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5519  electron transfer flavoprotein subunit beta  55.82 
 
 
249 aa  285  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0864  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.63 
 
 
249 aa  285  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0174422  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7804  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.22 
 
 
446 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2131  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.22 
 
 
249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0923  electron transfer flavoprotein subunit beta  56.22 
 
 
249 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421451  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.82 
 
 
249 aa  282  4.0000000000000003e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3781  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.83 
 
 
249 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3143  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.02 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2730  electron transfer flavoprotein subunit beta  56.22 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1352  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.63 
 
 
249 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00189671  hitchhiker  0.00845091 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1417  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.63 
 
 
249 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000497046  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2511  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.22 
 
 
249 aa  280  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6870  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.42 
 
 
249 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562162  normal  0.410167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1211  electron transfer flavoprotein subunit beta  55.42 
 
 
249 aa  280  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1405  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.22 
 
 
249 aa  279  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000200993  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3145  electron transfer flavoprotein, beta subunit  55.82 
 
 
249 aa  277  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1511  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.82 
 
 
249 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178615  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2866  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.82 
 
 
249 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000232207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2995  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.82 
 
 
249 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0119952  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1752  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.23 
 
 
249 aa  276  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0841122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2847  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.82 
 
 
249 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000762035  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0250  electron transfer flavoprotein subunit beta EtfB  56.72 
 
 
249 aa  275  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.42 
 
 
249 aa  275  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1995  electron transfer flavoprotein subunit beta  55.02 
 
 
249 aa  275  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184939  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.42 
 
 
249 aa  275  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2185  electron transfer flavoprotein, beta subunit  54.62 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2960  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.42 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2133  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.22 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.22 
 
 
249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.42 
 
 
249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1465  electron transfer flavoprotein subunit beta  57.43 
 
 
249 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135999  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1290  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.43 
 
 
249 aa  271  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0308703  normal  0.0442598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15180  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.02 
 
 
249 aa  271  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2268  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.42 
 
 
249 aa  271  9e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.074688  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0421  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.02 
 
 
249 aa  270  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0819  electron transfer flavoprotein subunit beta  55.02 
 
 
249 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000407  electron transfer flavoprotein beta subunit  55.42 
 
 
250 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.674522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4202  electron transfer flavoprotein, beta subunit  54.22 
 
 
249 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0953  electron transfer flavoprotein subunit beta  54.22 
 
 
249 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2174  electron transfer flavoprotein subunit beta  54.62 
 
 
249 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4117  electron transfer flavoprotein subunit beta  54.62 
 
 
249 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.838389  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3526  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.62 
 
 
249 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0460  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  53.82 
 
 
249 aa  269  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1651  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  54.22 
 
 
249 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2584  electron transfer flavoprotein beta-subunit  53.82 
 
 
249 aa  270  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000331041  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2209  electron transfer flavoprotein beta-subunit  53.82 
 
 
249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3774  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.22 
 
 
249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1471  electron transfer flavoprotein beta-subunit  54.22 
 
 
249 aa  269  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00534232  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0984  electron transfer flavoprotein subunit beta  53.82 
 
 
249 aa  268  5e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2159  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  53.41 
 
 
249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>