More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0532 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0532  electron transport flavoprotein beta-subunit  100 
 
 
249 aa  487  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0527  electron transfer flavoprotein beta-subunit  99.6 
 
 
249 aa  486  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0240946  hitchhiker  0.00903597 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0614  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  92.37 
 
 
249 aa  457  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.347072  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1471  electron transfer flavoprotein beta-subunit  73.09 
 
 
249 aa  360  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00534232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2707  electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.68 
 
 
249 aa  347  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.462646  normal  0.372016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3687  electron transfer flavoprotein, beta subunit  69.08 
 
 
250 aa  345  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00996  electron transfer flavoprotein, beta subunit  71.08 
 
 
250 aa  345  3e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2209  electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.68 
 
 
249 aa  345  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25860  electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.68 
 
 
249 aa  345  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.064795  normal  0.177804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4202  electron transfer flavoprotein, beta subunit  70.28 
 
 
249 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1651  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  70.28 
 
 
249 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3526  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  70.28 
 
 
249 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2146  electron transfer flavoprotein beta-subunit  69.88 
 
 
271 aa  343  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0676192  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3774  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  69.88 
 
 
249 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2584  electron transfer flavoprotein beta-subunit  69.08 
 
 
249 aa  341  5e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000331041  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4117  electron transfer flavoprotein subunit beta  69.88 
 
 
249 aa  340  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.838389  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15180  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.67 
 
 
249 aa  340  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.27 
 
 
249 aa  340  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2185  electron transfer flavoprotein, beta subunit  69.48 
 
 
249 aa  339  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2174  electron transfer flavoprotein subunit beta  69.88 
 
 
249 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1613  electron transfer flavoprotein beta-subunit  69.48 
 
 
250 aa  340  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44944  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1995  electron transfer flavoprotein subunit beta  69.48 
 
 
249 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184939  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14280  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.07 
 
 
256 aa  335  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577888  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2855  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.07 
 
 
249 aa  333  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3236  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.67 
 
 
249 aa  333  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.654108 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3160  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  332  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1998  ATPase  67.47 
 
 
249 aa  331  6e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00163986  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0178  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.31 
 
 
249 aa  330  1e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1608  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  330  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2159  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.07 
 
 
249 aa  329  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  329  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  329  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0857  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.47 
 
 
249 aa  328  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0217  electron transfer flavoprotein beta subunit  64.68 
 
 
252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1140  electron transfer flavoprotein subunit beta  65.86 
 
 
249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1352  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00189671  hitchhiker  0.00845091 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1417  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000497046  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1405  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000200993  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4307  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2168  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  325  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0160278  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2748  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.86 
 
 
249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1971  electron transfer flavoprotein, beta subunit  64.2 
 
 
248 aa  325  5e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5232  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0937638  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1896  electron transfer flavoprotein, beta subunit  64.2 
 
 
248 aa  325  5e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2511  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  325  6e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1211  electron transfer flavoprotein subunit beta  66.27 
 
 
249 aa  324  6e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  325  6e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2390  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  324  9e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.424195  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3145  electron transfer flavoprotein, beta subunit  65.06 
 
 
249 aa  323  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1402  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  323  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.881408  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3033  electron transfer flavoprotein beta-subunit  64.66 
 
 
249 aa  323  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  63.45 
 
 
249 aa  323  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  64.66 
 
 
249 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2847  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000762035  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.45 
 
 
249 aa  323  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1445  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  322  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0968162  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3781  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  322  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1511  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178615  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2866  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000232207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2995  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0119952  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1011  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.37 
 
 
248 aa  322  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3196  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  66.26 
 
 
249 aa  322  4e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.410827  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2550  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.8 
 
 
252 aa  322  5e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321051  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0819  electron transfer flavoprotein subunit beta  64.66 
 
 
249 aa  321  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  321  7e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2810  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  321  7e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194225  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0512  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  321  7e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.05 
 
 
249 aa  321  8e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000795792  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2532  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.67 
 
 
249 aa  321  8e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.944652  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3012  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  321  9.000000000000001e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0546  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.64 
 
 
253 aa  320  9.000000000000001e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2131  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  321  9.000000000000001e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0864  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0174422  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3731  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2007  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.86 
 
 
249 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760163  normal  0.289135 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2550  electron transfer flavoprotein subunit beta  64.66 
 
 
249 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0793  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  319  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal  0.477243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0456  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.35 
 
 
250 aa  319  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3169  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.35 
 
 
250 aa  319  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3143  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.86 
 
 
249 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2730  electron transfer flavoprotein subunit beta  63.86 
 
 
249 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1691  electron transfer flavoprotein subunit beta  62.06 
 
 
253 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0324  electron transfer flavoprotein beta-subunit  62.06 
 
 
253 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171629  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1223  electron transfer flavoprotein beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  318  7e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal  0.15593 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2556  electron transfer flavoprotein beta-subunit  61.66 
 
 
253 aa  317  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629709  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0460  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.65 
 
 
249 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0923  electron transfer flavoprotein subunit beta  64.26 
 
 
249 aa  315  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421451  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6309  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.25 
 
 
249 aa  315  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0421  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  315  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2960  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.65 
 
 
249 aa  315  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9247  electron transfer flavoprotein beta subunit  65.46 
 
 
249 aa  315  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0111601  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2268  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.86 
 
 
249 aa  315  5e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.074688  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1194  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.66 
 
 
249 aa  315  6e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2093  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.86 
 
 
249 aa  315  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4880  electron transfer flavoprotein beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  314  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0654  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.87 
 
 
249 aa  314  7e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1169  electron transfer flavoprotein, beta subunit  64.66 
 
 
249 aa  314  7e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000191925  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3374  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.66 
 
 
249 aa  314  8e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7939  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.25 
 
 
249 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103189  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4010  electron transfer flavoprotein beta subunit  65.86 
 
 
249 aa  314  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>