More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1778 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1778  electron transfer flavoprotein beta-subunit  100 
 
 
255 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1698  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  78.43 
 
 
255 aa  348  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.214951  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  49.62 
 
 
260 aa  235  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3648  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  49.22 
 
 
257 aa  228  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2862  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  48.25 
 
 
257 aa  227  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  48.06 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2626  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  47.86 
 
 
257 aa  215  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1591  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  44.58 
 
 
252 aa  205  6e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4258  electron transfer flavoprotein, beta subunit (beta-ETF)  45.53 
 
 
257 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4650  electron transfer flavoprotein, beta subunit  46.51 
 
 
257 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4651  electron transfer flavoprotein, beta subunit  45.53 
 
 
257 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4635  electron transfer flavoprotein, beta subunit  45.53 
 
 
257 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4270  electron transfer flavoprotein, beta subunit (beta-ETF)  45.53 
 
 
257 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3223  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.14 
 
 
257 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4419  electron transfer flavoprotein subunit beta  45.14 
 
 
257 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4760  electron transfer flavoprotein subunit beta  45.14 
 
 
257 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4351  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.53 
 
 
257 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0604  electron transfer flavoprotein, beta subunit  45.14 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4631  electron transfer flavoprotein, beta subunit  45.14 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00479771  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0696  electron transfer flavoprotein, beta subunit  47.29 
 
 
252 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1432  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36.72 
 
 
255 aa  164  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135949  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1858  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  40.84 
 
 
263 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  0.923752 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0218  electron transfer flavoprotein, beta subunit  42.15 
 
 
249 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0411  electron transfer flavoprotein, beta subunit  42.15 
 
 
249 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2928  electron transfer flavoprotein, beta subunit  42.15 
 
 
249 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2977  electron transfer flavoprotein, beta subunit  42.15 
 
 
249 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2555  electron transfer flavoprotein, beta subunit  42.15 
 
 
249 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0931  electron transfer flavoprotein, beta subunit  42.15 
 
 
249 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1653  electron transfer flavoprotein, beta subunit  42.15 
 
 
249 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2867  electron transfer flavoprotein, beta subunit  42.15 
 
 
249 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3300  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.74 
 
 
258 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0512  electron transfer flavoprotein beta-subunit  41.98 
 
 
249 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0106  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.7 
 
 
266 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0571766  normal  0.27576 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2242  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.15 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438561  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1021  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.15 
 
 
249 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1062  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.15 
 
 
249 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4175  electron transfer flavoprotein subunit beta  40.15 
 
 
249 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00698848  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0583  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.15 
 
 
249 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3929  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0938  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.77 
 
 
249 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0942  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.77 
 
 
249 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85841  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7298  electron transfer flavoprotein subunit beta  40.93 
 
 
249 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207608  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0793  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.55 
 
 
249 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal  0.477243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1211  electron transfer flavoprotein subunit beta  40.68 
 
 
249 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0923  electron transfer flavoprotein subunit beta  39.08 
 
 
249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421451  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0762  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.22 
 
 
249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2550  electron transfer flavoprotein subunit beta  39 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5519  electron transfer flavoprotein subunit beta  39 
 
 
249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0052  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.45 
 
 
267 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4829  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.84 
 
 
249 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0864  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.79 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0174422  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4092  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  38.43 
 
 
259 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1713  electron transfer flavoprotein subunit beta  37.5 
 
 
258 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0048  electron transfer flavoprotein subunit beta  37.09 
 
 
267 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201001  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0064  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.09 
 
 
267 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.718343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0737  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.61 
 
 
267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0122378  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0256  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.6 
 
 
259 aa  144  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0672629  normal  0.0851543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2540  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.16 
 
 
249 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011084 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  37.86 
 
 
259 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1037  electron transfer flavoprotein, beta subunit  39.75 
 
 
250 aa  144  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.261104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3374  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.78 
 
 
249 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3166  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.73 
 
 
267 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0998  electron transfer flavoprotein subunit beta  38.31 
 
 
249 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740496  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2950  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.09 
 
 
258 aa  142  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.7 
 
 
249 aa  142  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2985  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.31 
 
 
249 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26291  hitchhiker  0.000621115 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2519  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.95 
 
 
258 aa  142  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.79 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1194  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.02 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1290  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.15 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0308703  normal  0.0442598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0857  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.7 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6309  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.83 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3598  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.64 
 
 
249 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2153  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.61 
 
 
258 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000153596  normal  0.854717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0421  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.92 
 
 
249 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36.63 
 
 
259 aa  139  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0763  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.88 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.944822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  38.02 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2268  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.51 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.074688  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4188  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.55 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750076 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  38.61 
 
 
249 aa  139  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1957  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.63 
 
 
249 aa  138  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.41834  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17860  predicted protein  35.25 
 
 
253 aa  138  7e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.587324  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2390  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.64 
 
 
249 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.424195  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1402  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.02 
 
 
249 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.881408  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4166  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.63 
 
 
249 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1469  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.98 
 
 
258 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2133  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.29 
 
 
249 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1223  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.02 
 
 
249 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal  0.15593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6581  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  34.51 
 
 
272 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0953  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.91 
 
 
249 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3570  putative electron transfer flavoprotein beta- subunit  36.64 
 
 
249 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1011  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.08 
 
 
248 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1359  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.33 
 
 
243 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1601  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.84 
 
 
258 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2354  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  37.19 
 
 
259 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3012  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.02 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1240  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36.05 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854094  normal  0.0273988 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2784  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.23 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8114  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.63 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673435 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1465  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.68 
 
 
249 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135999  normal  0.480235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>