More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3038 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3038  electron transfer flavoprotein beta-subunit  100 
 
 
286 aa  583  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1601  electron transfer flavoprotein beta-subunit  79.84 
 
 
258 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  79.84 
 
 
260 aa  431  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1713  electron transfer flavoprotein subunit beta  79.46 
 
 
258 aa  427  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2153  electron transfer flavoprotein subunit beta  80.23 
 
 
258 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000153596  normal  0.854717 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1383  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  79.46 
 
 
260 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2784  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  75.58 
 
 
258 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3300  electron transfer flavoprotein subunit beta  73.64 
 
 
258 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1469  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  75.19 
 
 
258 aa  408  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2263  electron transfer flavoprotein subunit beta  78.68 
 
 
258 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.204699  hitchhiker  0.00000125748 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1333  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  70.16 
 
 
258 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2950  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  70.16 
 
 
258 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2519  electron transfer flavoprotein beta-subunit  64.73 
 
 
258 aa  344  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3697  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.54 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.264298  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.06 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1432  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  38.64 
 
 
255 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135949  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.43 
 
 
258 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2862  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.63 
 
 
257 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2626  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.83 
 
 
257 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4650  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.93 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3223  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.93 
 
 
257 aa  155  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4419  electron transfer flavoprotein subunit beta  38.93 
 
 
257 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4760  electron transfer flavoprotein subunit beta  38.93 
 
 
257 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4270  electron transfer flavoprotein, beta subunit (beta-ETF)  38.55 
 
 
257 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4635  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.55 
 
 
257 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4651  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.55 
 
 
257 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0604  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.55 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4631  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.55 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00479771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4351  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.4 
 
 
257 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1923  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.85 
 
 
258 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00262008  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3166  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.62 
 
 
267 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0106  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.58 
 
 
266 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0571766  normal  0.27576 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4258  electron transfer flavoprotein, beta subunit (beta-ETF)  38.17 
 
 
257 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3648  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.48 
 
 
257 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0387  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.78 
 
 
262 aa  149  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0719  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.89 
 
 
253 aa  149  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.02869  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1140  electron transfer flavoprotein subunit beta  39.44 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1591  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  37.65 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0456  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.13 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3169  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.13 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.29 
 
 
249 aa  146  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921164  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.44 
 
 
249 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0819  electron transfer flavoprotein subunit beta  42.36 
 
 
249 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2146  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.65 
 
 
271 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0676192  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.6 
 
 
250 aa  143  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1608  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.87 
 
 
249 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.41 
 
 
249 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.36 
 
 
249 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  41.87 
 
 
249 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.41 
 
 
249 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5232  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.43 
 
 
249 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0937638  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3271  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.75 
 
 
249 aa  142  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2855  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.95 
 
 
249 aa  142  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17860  predicted protein  36.36 
 
 
253 aa  142  7e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.587324  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3331  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.59 
 
 
264 aa  142  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0737  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.15 
 
 
267 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0122378  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0753  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.4 
 
 
251 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4880  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.89 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2550  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.89 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321051  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.57 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0763  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.944822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1471  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.84 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00534232  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1270  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  35.88 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.464463 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1389  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.35 
 
 
263 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2550  electron transfer flavoprotein subunit beta  37.15 
 
 
249 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2511  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.14 
 
 
249 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2748  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.22 
 
 
249 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02100  mitochondrion protein, putative  37.9 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0512  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.76 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28260  electron transfer flavoprotein, beta subunit  37.35 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0957  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.03 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321568  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.9 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  38.57 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1006  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.03 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7939  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.81 
 
 
249 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103189  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3826  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.59 
 
 
263 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.18221  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0925  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.03 
 
 
249 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0986  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.03 
 
 
249 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4188  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.76 
 
 
249 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750076 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5519  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.76 
 
 
249 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3145  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.63 
 
 
249 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1438  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  37.65 
 
 
260 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0597474  normal  0.920137 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6870  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.53 
 
 
249 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562162  normal  0.410167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2584  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.95 
 
 
249 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000331041  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1352  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.03 
 
 
249 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00189671  hitchhiker  0.00845091 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1417  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.03 
 
 
249 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000497046  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0411  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.34 
 
 
249 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2977  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.34 
 
 
249 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2639  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.65 
 
 
249 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1653  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.34 
 
 
249 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0864  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.36 
 
 
249 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0174422  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2007  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.41 
 
 
249 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760163  normal  0.289135 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2555  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.34 
 
 
249 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3781  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.44 
 
 
249 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36.55 
 
 
259 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0218  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.34 
 
 
249 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2928  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.34 
 
 
249 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2867  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.34 
 
 
249 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101956  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1037  electron transfer flavoprotein, beta subunit  33.85 
 
 
250 aa  137  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.261104  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1405  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.55 
 
 
249 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000200993  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>