45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5069 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5069  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  100 
 
 		 258 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737153  hitchhiker  0.00306508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1579  putative electron transfer flavoprotein beta- subunit  90.31 
 
 		 258 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3552  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  73.26 
 
 		 261 aa  363  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3297  electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.82 
 
 		 259 aa  352  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5079  electron transfer flavoprotein beta-subunit  69.77 
 
 		 261 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3289  electron transfer flavoprotein beta-subunit  69.77 
 
 		 261 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5206  electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.66 
 
 		 261 aa  344  8e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404054  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0061  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.04 
 
 		 261 aa  339  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4491  electron transfer flavoprotein beta-subunit  69.77 
 
 		 261 aa  337  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5016  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  68.99 
 
 		 261 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  normal  0.568538 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0577  electron transfer flavoprotein subunit beta  69.38 
 
 		 261 aa  332  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4816  electron transfer flavoprotein subunit beta  67.7 
 
 		 261 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0746  putative electron transfer flavoprotein subunit  69.14 
 
 		 261 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2113  electron transfer flavoprotein, beta subunit  69.14 
 
 		 261 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0834  putative electron transfer flavoprotein subunit  69.14 
 
 		 261 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1862  hypothetical protein  68.36 
 
 		 261 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1973  hypothetical protein  68.36 
 
 		 261 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16526  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1000  hypothetical protein  68.36 
 
 		 261 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0704  hypothetical protein  68.36 
 
 		 261 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.970472  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0477  hypothetical protein  68.36 
 
 		 261 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5220  electron transfer flavoprotein subunit beta  40.46 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456604  hitchhiker  0.00238427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0399  electron transfer flavoprotein, beta subunit  39.23 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2721  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.27 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.768779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0334  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  40.15 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507575  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0336  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.15 
 
 		 256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4894  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.15 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124333  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0313  electron transfer flavoprotein, beta subunit, putative  39.77 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000451759  hitchhiker  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4779  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.78 
 
 		 265 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.378484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0492  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.74 
 
 		 257 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0993  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.47 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.246405  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6188  hypothetical protein  38.46 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71310  hypothetical protein  38.4 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4056  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.68 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3998  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.55 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.29 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3401  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.87 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4014  hypothetical protein  33.21 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3743  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.58 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.167959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4038  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.8 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197772  normal  0.383173 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0997  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.14 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075217  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0655  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  30.52 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1778  electron transfer flavoprotein beta-subunit  29.61 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1841  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  38.55 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3760  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.21 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0674596  hitchhiker  0.00129982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2087  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  26.43 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.859771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>