39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4056 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4056  electron transfer flavoprotein, beta subunit  100 
 
 		 267 aa  514  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3297  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.33 
 
 		 259 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3552  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.27 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5206  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.69 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5079  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.52 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3289  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.52 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5016  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.47 
 
 		 261 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  normal  0.568538 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4491  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.56 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0061  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.24 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0577  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.02 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4816  electron transfer flavoprotein subunit beta  37.04 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0746  putative electron transfer flavoprotein subunit  35.8 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0834  putative electron transfer flavoprotein subunit  35.8 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2113  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.8 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1862  hypothetical protein  33.2 
 
 		 261 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1973  hypothetical protein  35.41 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16526  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1000  hypothetical protein  35.41 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0704  hypothetical protein  35.41 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.970472  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0477  hypothetical protein  35.41 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5069  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.83 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737153  hitchhiker  0.00306508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1579  putative electron transfer flavoprotein beta- subunit  36.67 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0993  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.52 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.246405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5220  electron transfer flavoprotein subunit beta  38.2 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456604  hitchhiker  0.00238427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0492  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.52 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4894  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.83 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124333  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0313  electron transfer flavoprotein, beta subunit, putative  36.58 
 
 		 256 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000451759  hitchhiker  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0336  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.58 
 
 		 256 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0334  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  36.58 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507575  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4014  hypothetical protein  33.08 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2721  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.81 
 
 		 258 aa  90.5  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.768779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4779  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.07 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.378484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0399  electron transfer flavoprotein, beta subunit  34.1 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6188  hypothetical protein  36.22 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71310  hypothetical protein  36.22 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3998  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.23 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3401  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.64 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0997  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.86 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075217  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4038  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.75 
 
 		 264 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197772  normal  0.383173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>