48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3297 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3297  electron transfer flavoprotein beta-subunit  100 
 
 		 259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5079  electron transfer flavoprotein beta-subunit  78.43 
 
 		 261 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3289  electron transfer flavoprotein beta-subunit  78.43 
 
 		 261 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5206  electron transfer flavoprotein beta-subunit  78.43 
 
 		 261 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3552  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  76.17 
 
 		 261 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5016  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  76.17 
 
 		 261 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  normal  0.568538 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4491  electron transfer flavoprotein beta-subunit  76.17 
 
 		 261 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0577  electron transfer flavoprotein subunit beta  76.08 
 
 		 261 aa  371  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0061  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  73.83 
 
 		 261 aa  364  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4816  electron transfer flavoprotein subunit beta  72.41 
 
 		 261 aa  351  7e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239408  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0834  putative electron transfer flavoprotein subunit  73.64 
 
 		 261 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0746  putative electron transfer flavoprotein subunit  73.64 
 
 		 261 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2113  electron transfer flavoprotein, beta subunit  73.64 
 
 		 261 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1862  hypothetical protein  72.09 
 
 		 261 aa  342  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763652  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0477  hypothetical protein  72.87 
 
 		 261 aa  341  8e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0704  hypothetical protein  72.87 
 
 		 261 aa  341  8e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.970472  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1973  hypothetical protein  72.87 
 
 		 261 aa  341  8e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16526  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1000  hypothetical protein  72.87 
 
 		 261 aa  341  8e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5069  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.82 
 
 		 258 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737153  hitchhiker  0.00306508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1579  putative electron transfer flavoprotein beta- subunit  71.6 
 
 		 258 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2721  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.69 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.768779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0492  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.29 
 
 		 257 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0334  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  38.04 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507575  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4894  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.04 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124333  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0336  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.04 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0313  electron transfer flavoprotein, beta subunit, putative  37.65 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000451759  hitchhiker  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5220  electron transfer flavoprotein subunit beta  38.82 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456604  hitchhiker  0.00238427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0399  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.04 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0993  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.27 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.246405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71310  hypothetical protein  40.39 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6188  hypothetical protein  40 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4779  electron transfer flavoprotein, beta subunit  37.35 
 
 		 265 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.378484 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4014  hypothetical protein  33.83 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4056  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.47 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3401  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.27 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3998  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.97 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3743  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.02 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.167959 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0997  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.07 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075217  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.27 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4038  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.52 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197772  normal  0.383173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  33 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0914  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.74 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0862811 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0655  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  28.48 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1432  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.56 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.52 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2006  electron transfer flavoprotein beta-subunit  27.54 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.249867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  34.65 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1841  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  34.4 
 
 		 256 aa  42  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349047  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>