39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2481 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  100 
 
 
260 aa  485  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3743  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.05 
 
 
264 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.167959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3998  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.8 
 
 
263 aa  278  9e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4038  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.05 
 
 
264 aa  275  6e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197772  normal  0.383173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3401  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59 
 
 
265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0997  electron transfer flavoprotein beta-subunit  46.25 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075217  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0993  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.58 
 
 
267 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.246405  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0492  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.38 
 
 
257 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0313  electron transfer flavoprotein, beta subunit, putative  35.43 
 
 
256 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000451759  hitchhiker  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0336  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.43 
 
 
256 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000035876  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0334  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  35.43 
 
 
256 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507575  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4894  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.04 
 
 
256 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124333  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0399  electron transfer flavoprotein, beta subunit  34.63 
 
 
265 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4779  electron transfer flavoprotein, beta subunit  34.63 
 
 
265 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.378484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5220  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.77 
 
 
256 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456604  hitchhiker  0.00238427 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5069  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.29 
 
 
258 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737153  hitchhiker  0.00306508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6188  hypothetical protein  34.65 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71310  hypothetical protein  34.65 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166742  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2721  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.8 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.768779  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3552  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.83 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5206  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.18 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404054  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3289  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.39 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5079  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.39 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4014  hypothetical protein  30.8 
 
 
263 aa  78.6  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1579  putative electron transfer flavoprotein beta- subunit  33.72 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221844  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0577  electron transfer flavoprotein subunit beta  33.73 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4491  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.39 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5016  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.99 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  normal  0.568538 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3297  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.27 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4816  electron transfer flavoprotein subunit beta  33.46 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239408  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0061  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.93 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1862  hypothetical protein  32.41 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763652  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0746  putative electron transfer flavoprotein subunit  31.89 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0834  putative electron transfer flavoprotein subunit  31.89 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2113  electron transfer flavoprotein, beta subunit  31.89 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1973  hypothetical protein  31.89 
 
 
261 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16526  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1000  hypothetical protein  31.89 
 
 
261 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0704  hypothetical protein  31.89 
 
 
261 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.970472  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0477  hypothetical protein  31.89 
 
 
261 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>