59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0477 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0704  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  507  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.970472  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1973  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  507  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0477  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  507  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1000  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  507  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0746  putative electron transfer flavoprotein subunit  99.23 
 
 
261 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0834  putative electron transfer flavoprotein subunit  99.23 
 
 
261 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2113  electron transfer flavoprotein, beta subunit  99.23 
 
 
261 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1862  hypothetical protein  92.34 
 
 
261 aa  427  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763652  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3552  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  79.31 
 
 
261 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3289  electron transfer flavoprotein beta-subunit  79.31 
 
 
261 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5079  electron transfer flavoprotein beta-subunit  79.31 
 
 
261 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5206  electron transfer flavoprotein beta-subunit  78.54 
 
 
261 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404054  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4491  electron transfer flavoprotein beta-subunit  79.31 
 
 
261 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0061  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  77.01 
 
 
261 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5016  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  78.54 
 
 
261 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  normal  0.568538 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0577  electron transfer flavoprotein subunit beta  78.16 
 
 
261 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4816  electron transfer flavoprotein subunit beta  75.1 
 
 
261 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239408  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3297  electron transfer flavoprotein beta-subunit  72.87 
 
 
259 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5069  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.36 
 
 
258 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737153  hitchhiker  0.00306508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1579  putative electron transfer flavoprotein beta- subunit  70.16 
 
 
258 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221844  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5220  electron transfer flavoprotein subunit beta  38.4 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456604  hitchhiker  0.00238427 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2721  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.6 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.768779  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0399  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.51 
 
 
265 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4894  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.65 
 
 
256 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124333  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0492  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.73 
 
 
257 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0334  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  35.86 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507575  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0993  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.72 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.246405  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0336  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.86 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000035876  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0313  electron transfer flavoprotein, beta subunit, putative  35.46 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000451759  hitchhiker  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4779  electron transfer flavoprotein, beta subunit  33.85 
 
 
265 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.378484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6188  hypothetical protein  36.86 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71310  hypothetical protein  36.47 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166742  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4014  hypothetical protein  32.84 
 
 
263 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4056  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.94 
 
 
267 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3401  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.59 
 
 
265 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3998  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.78 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3743  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.8 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.167959 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0997  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.86 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075217  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4038  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.43 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197772  normal  0.383173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.4 
 
 
260 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0914  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.09 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0862811 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2006  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.67 
 
 
278 aa  52  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.249867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0756  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.32 
 
 
256 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.480219 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1841  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  38.71 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349047  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2213  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.18 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0185334  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2899  electron transfer flavoprotein  30.67 
 
 
259 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0106  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.9 
 
 
266 aa  45.4  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0571766  normal  0.27576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1823  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  38.83 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0520977 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02578  hypothetical protein  31.29 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02615  predicted flavoprotein  31.29 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  32.14 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0942  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.29 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.950747 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0918  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.29 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4026  electron transfer flavoprotein  30.41 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2910  electron transfer flavoprotein  30.41 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3072  electron transfer flavoprotein  31.29 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.739339  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  30.92 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1474  electron transfer flavoprotein beta-subunit  28.78 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0655  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  27.44 
 
 
259 aa  42.4  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>