88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4491 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4491  electron transfer flavoprotein beta-subunit  100 
 
 		 261 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5016  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  99.23 
 
 		 261 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  normal  0.568538 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5079  electron transfer flavoprotein beta-subunit  93.1 
 
 		 261 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3289  electron transfer flavoprotein beta-subunit  93.1 
 
 		 261 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5206  electron transfer flavoprotein beta-subunit  92.34 
 
 		 261 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3552  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  88.89 
 
 		 261 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0577  electron transfer flavoprotein subunit beta  93.1 
 
 		 261 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0061  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  83.14 
 
 		 261 aa  418  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4816  electron transfer flavoprotein subunit beta  78.93 
 
 		 261 aa  390  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239408  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3297  electron transfer flavoprotein beta-subunit  76.17 
 
 		 259 aa  387  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2113  electron transfer flavoprotein, beta subunit  80.08 
 
 		 261 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0834  putative electron transfer flavoprotein subunit  80.08 
 
 		 261 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1862  hypothetical protein  78.93 
 
 		 261 aa  368  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763652  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0746  putative electron transfer flavoprotein subunit  80.08 
 
 		 261 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0704  hypothetical protein  79.31 
 
 		 261 aa  364  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.970472  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0477  hypothetical protein  79.31 
 
 		 261 aa  364  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1000  hypothetical protein  79.31 
 
 		 261 aa  364  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1973  hypothetical protein  79.31 
 
 		 261 aa  364  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16526  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5069  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  69.77 
 
 		 258 aa  334  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737153  hitchhiker  0.00306508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1579  putative electron transfer flavoprotein beta- subunit  70.54 
 
 		 258 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2721  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.51 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.768779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0334  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  37.25 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507575  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0492  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.61 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0336  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.25 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4894  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.86 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124333  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0313  electron transfer flavoprotein, beta subunit, putative  36.86 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000451759  hitchhiker  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0993  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.5 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.246405  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0399  electron transfer flavoprotein, beta subunit  37.25 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5220  electron transfer flavoprotein subunit beta  37.65 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456604  hitchhiker  0.00238427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4779  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.14 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.378484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71310  hypothetical protein  37.8 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4056  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.47 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6188  hypothetical protein  37.4 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4014  hypothetical protein  31.13 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.18 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3998  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.97 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3743  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.43 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.167959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3401  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.21 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4038  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.29 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197772  normal  0.383173 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0997  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.51 
 
 		 256 aa  72  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075217  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.15 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  34.62 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28260  electron transfer flavoprotein, beta subunit  33.52 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0914  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.39 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0862811 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0756  electron transfer flavoprotein beta-subunit  30 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.480219 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2006  electron transfer flavoprotein beta-subunit  29.95 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.249867 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  32.42 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0655  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  31.79 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1438  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  34.34 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0597474  normal  0.920137 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0684  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.88 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.965438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8114  electron transfer flavoprotein beta-subunit  29.95 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.673435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1474  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.33 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1591  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.86 
 
 		 252 aa  52.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2213  electron transfer flavoprotein beta-subunit  28.11 
 
 		 256 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0185334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0256  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.77 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0672629  normal  0.0851543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0106  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.62 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0571766  normal  0.27576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4092  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.4 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1432  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.95 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135949  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0584  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.4 
 
 		 260 aa  49.3  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1297  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.73 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1778  electron transfer flavoprotein beta-subunit  29.67 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2122  hypothetical protein  32.96 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0440  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  27.94 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.43 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.28 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1713  electron transfer flavoprotein subunit beta  30.63 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3300  electron transfer flavoprotein subunit beta  25.2 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1525  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.36 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2354  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  29.08 
 
 		 259 aa  45.4  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1074  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.6 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1077  electron transfer flavoprotein, beta subunit  25.57 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3679  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  30 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1103  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.28 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0274897  normal  0.0559611 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1576  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.1 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497736 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1823  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.02 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0520977 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1698  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.33 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.214951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2550  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.87 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0696  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.1 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3826  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  37.11 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.18221  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13278  electron transfer flavoprotein (beta subunit)  32.37 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1262  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  30.43 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1545  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  25.68 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0577  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  26.39 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3169  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.32 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0456  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.32 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12624  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13045  electron transfer flavoprotein beta subunit fixA  29.75 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000726772  hitchhiker  0.00331196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3260  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  26.82 
 
 		 261 aa  42  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1210  electron transfer flavoprotein beta-subunit  27.62 
 
 		 259 aa  42  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>