40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3743 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3743  electron transfer flavoprotein beta-subunit  100 
 
 		 264 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.167959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4038  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  93.94 
 
 		 264 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197772  normal  0.383173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3998  electron transfer flavoprotein beta-subunit  84.85 
 
 		 263 aa  374  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.05 
 
 		 260 aa  304  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3401  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  60.9 
 
 		 265 aa  281  9e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0997  electron transfer flavoprotein beta-subunit  44.44 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075217  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0993  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.55 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.246405  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0492  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.52 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0399  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.02 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0313  electron transfer flavoprotein, beta subunit, putative  35.55 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000451759  hitchhiker  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0334  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  35.55 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507575  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0336  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.55 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4894  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.16 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124333  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6188  hypothetical protein  36.68 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5220  electron transfer flavoprotein subunit beta  34.88 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456604  hitchhiker  0.00238427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4779  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.8 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.378484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71310  hypothetical protein  36.68 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5206  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.45 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5069  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.58 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737153  hitchhiker  0.00306508 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5079  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.47 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3289  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.47 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0577  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.08 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3552  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.33 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3297  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.15 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1579  putative electron transfer flavoprotein beta- subunit  34.62 
 
 		 258 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5016  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.52 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  normal  0.568538 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0061  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.65 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4816  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.88 
 
 		 261 aa  92  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239408  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4491  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.52 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0746  putative electron transfer flavoprotein subunit  36.82 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0834  putative electron transfer flavoprotein subunit  36.82 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2113  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.82 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1862  hypothetical protein  35.41 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763652  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4014  hypothetical protein  30.17 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2721  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.87 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.768779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1973  hypothetical protein  36.05 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16526  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1000  hypothetical protein  36.05 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0704  hypothetical protein  36.05 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.970472  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0477  hypothetical protein  36.05 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4056  electron transfer flavoprotein, beta subunit  34.9 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.120571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>