67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0061 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0061  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  100 
 
 		 261 aa  511  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3552  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  84.29 
 
 		 261 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5079  electron transfer flavoprotein beta-subunit  81.99 
 
 		 261 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3289  electron transfer flavoprotein beta-subunit  81.99 
 
 		 261 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5206  electron transfer flavoprotein beta-subunit  81.99 
 
 		 261 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4491  electron transfer flavoprotein beta-subunit  83.14 
 
 		 261 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5016  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  83.14 
 
 		 261 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  normal  0.568538 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0577  electron transfer flavoprotein subunit beta  82.76 
 
 		 261 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4816  electron transfer flavoprotein subunit beta  76.25 
 
 		 261 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239408  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3297  electron transfer flavoprotein beta-subunit  73.83 
 
 		 259 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2113  electron transfer flavoprotein, beta subunit  77.78 
 
 		 261 aa  363  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0746  putative electron transfer flavoprotein subunit  77.78 
 
 		 261 aa  363  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0834  putative electron transfer flavoprotein subunit  77.78 
 
 		 261 aa  363  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0477  hypothetical protein  77.01 
 
 		 261 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1973  hypothetical protein  77.01 
 
 		 261 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16526  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1000  hypothetical protein  77.01 
 
 		 261 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0704  hypothetical protein  77.01 
 
 		 261 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.970472  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1862  hypothetical protein  75.86 
 
 		 261 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763652  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5069  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.04 
 
 		 258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737153  hitchhiker  0.00306508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1579  putative electron transfer flavoprotein beta- subunit  70.04 
 
 		 258 aa  319  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0492  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.19 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2721  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.73 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.768779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0334  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  38.04 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507575  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0336  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.04 
 
 		 256 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0399  electron transfer flavoprotein, beta subunit  37.76 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5220  electron transfer flavoprotein subunit beta  37.65 
 
 		 256 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456604  hitchhiker  0.00238427 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0313  electron transfer flavoprotein, beta subunit, putative  37.65 
 
 		 256 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000451759  hitchhiker  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4894  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.65 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124333  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0993  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.63 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.246405  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4779  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.14 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.378484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6188  hypothetical protein  38.19 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71310  hypothetical protein  37.8 
 
 		 257 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4056  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.41 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4014  hypothetical protein  32.17 
 
 		 263 aa  95.9  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3998  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.6 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3401  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.03 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3743  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.04 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.167959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.81 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0997  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.26 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075217  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4038  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.86 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197772  normal  0.383173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  32.42 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0584  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.15 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1474  electron transfer flavoprotein beta-subunit  25.96 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  30.39 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0655  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  31.1 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8114  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.02 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.673435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1438  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.21 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0597474  normal  0.920137 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0914  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.93 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0862811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  30.22 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0756  electron transfer flavoprotein beta-subunit  28.57 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.480219 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0353  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  30.63 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28260  electron transfer flavoprotein, beta subunit  28.49 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2213  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.14 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0185334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2006  electron transfer flavoprotein beta-subunit  28.14 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.249867 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0684  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.24 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.965438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1297  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.9 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1432  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.33 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135949  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1713  electron transfer flavoprotein subunit beta  30.25 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.1 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0440  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  27.96 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3300  electron transfer flavoprotein subunit beta  24.19 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1525  electron transfer flavoprotein subunit beta  34.38 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0696  electron transfer flavoprotein, beta subunit  34.67 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.03 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4362  glycosyl transferase group 1  42.31 
 
 		 390 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2122  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2626  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.76 
 
 		 257 aa  42  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000104264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>