41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4038 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4038  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  100 
 
 		 264 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197772  normal  0.383173 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3743  electron transfer flavoprotein beta-subunit  93.94 
 
 		 264 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.167959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3998  electron transfer flavoprotein beta-subunit  85.23 
 
 		 263 aa  377  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.05 
 
 		 260 aa  304  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3401  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.28 
 
 		 265 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0997  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.63 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075217  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0993  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.79 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.246405  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0492  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.14 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0313  electron transfer flavoprotein, beta subunit, putative  35.55 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000451759  hitchhiker  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0336  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.55 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0334  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  35.55 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507575  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5220  electron transfer flavoprotein subunit beta  34.88 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456604  hitchhiker  0.00238427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4894  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.77 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124333  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6188  hypothetical protein  38.13 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0399  electron transfer flavoprotein, beta subunit  34.24 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71310  hypothetical protein  36.68 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5206  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.86 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5079  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.08 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3289  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.08 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4779  electron transfer flavoprotein, beta subunit  34.63 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.378484 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3552  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.33 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0577  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.69 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5069  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.58 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737153  hitchhiker  0.00306508 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3297  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.52 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4816  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.98 
 
 		 261 aa  92  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239408  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5016  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.14 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  normal  0.568538 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4491  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.36 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0061  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.25 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1579  putative electron transfer flavoprotein beta- subunit  34.88 
 
 		 258 aa  85.5  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0834  putative electron transfer flavoprotein subunit  36.61 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0746  putative electron transfer flavoprotein subunit  36.61 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2113  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.61 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1862  hypothetical protein  35.57 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763652  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4014  hypothetical protein  31.03 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1973  hypothetical protein  35.83 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16526  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1000  hypothetical protein  35.83 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0704  hypothetical protein  35.83 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.970472  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0477  hypothetical protein  35.83 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2721  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.96 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.768779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4056  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.14 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.22 
 
 		 325 aa  42  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>