66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5206 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5206  electron transfer flavoprotein beta-subunit  100 
 
 
261 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404054  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5079  electron transfer flavoprotein beta-subunit  98.85 
 
 
261 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3289  electron transfer flavoprotein beta-subunit  98.85 
 
 
261 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0577  electron transfer flavoprotein subunit beta  95.4 
 
 
261 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4491  electron transfer flavoprotein beta-subunit  92.34 
 
 
261 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5016  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  91.57 
 
 
261 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  normal  0.568538 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3552  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  85.44 
 
 
261 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0061  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  81.99 
 
 
261 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3297  electron transfer flavoprotein beta-subunit  78.43 
 
 
259 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4816  electron transfer flavoprotein subunit beta  77.39 
 
 
261 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239408  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0834  putative electron transfer flavoprotein subunit  79.31 
 
 
261 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0746  putative electron transfer flavoprotein subunit  79.31 
 
 
261 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2113  electron transfer flavoprotein, beta subunit  79.31 
 
 
261 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1862  hypothetical protein  76.63 
 
 
261 aa  359  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1000  hypothetical protein  78.54 
 
 
261 aa  358  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0704  hypothetical protein  78.54 
 
 
261 aa  358  4e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.970472  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1973  hypothetical protein  78.54 
 
 
261 aa  358  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0477  hypothetical protein  78.54 
 
 
261 aa  358  4e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5069  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.66 
 
 
258 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737153  hitchhiker  0.00306508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1579  putative electron transfer flavoprotein beta- subunit  70.16 
 
 
258 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221844  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2721  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.11 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.768779  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0492  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.85 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0993  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.25 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.246405  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0399  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.04 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0334  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  36.47 
 
 
256 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507575  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0336  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.47 
 
 
256 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000035876  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5220  electron transfer flavoprotein subunit beta  37.65 
 
 
256 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456604  hitchhiker  0.00238427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4894  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.47 
 
 
256 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124333  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0313  electron transfer flavoprotein, beta subunit, putative  36.08 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000451759  hitchhiker  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4779  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.95 
 
 
265 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.378484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71310  hypothetical protein  38.19 
 
 
257 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166742  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6188  hypothetical protein  37.8 
 
 
257 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4056  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.69 
 
 
267 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4014  hypothetical protein  32.68 
 
 
263 aa  105  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3998  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.15 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3743  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.61 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.167959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.18 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3401  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.59 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4038  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.86 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197772  normal  0.383173 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0997  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.66 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075217  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0914  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.39 
 
 
257 aa  53.5  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0862811 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0756  electron transfer flavoprotein beta-subunit  28.85 
 
 
256 aa  53.1  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.480219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  33.88 
 
 
259 aa  53.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1474  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.61 
 
 
248 aa  52  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1432  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36 
 
 
255 aa  52  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135949  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2006  electron transfer flavoprotein beta-subunit  29.91 
 
 
278 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.249867 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0655  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  31.13 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  30.9 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0584  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.58 
 
 
260 aa  49.7  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0353  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.99 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1591  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.99 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2122  hypothetical protein  32 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28260  electron transfer flavoprotein, beta subunit  30.73 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0684  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.33 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.965438 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2213  electron transfer flavoprotein beta-subunit  29.88 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0185334  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4092  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.54 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1438  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36.18 
 
 
260 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0597474  normal  0.920137 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1778  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.47 
 
 
255 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1297  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.2 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0577  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  26.71 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1359  electron transfer flavoprotein, beta subunit  31.47 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1713  electron transfer flavoprotein subunit beta  30 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1525  electron transfer flavoprotein subunit beta  33.33 
 
 
251 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3300  electron transfer flavoprotein subunit beta  24.4 
 
 
258 aa  42.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1262  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  30.43 
 
 
285 aa  42.4  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0440  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  27.23 
 
 
262 aa  42  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>