More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1880 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1880  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  100 
 
 
262 aa  529  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.190196 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2583  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  56.49 
 
 
259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2285  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.49 
 
 
259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1545  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  53.41 
 
 
261 aa  286  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1077  electron transfer flavoprotein, beta subunit  53.21 
 
 
261 aa  277  2e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210239 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0584  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.96 
 
 
260 aa  261  6.999999999999999e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1485  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  49.81 
 
 
262 aa  260  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0507333  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0058  electron transfer flavoprotein subunit beta  50.38 
 
 
267 aa  258  7e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001045 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1538  electron transfer flavoprotein beta-subunit  51.31 
 
 
265 aa  252  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.374456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1608  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  49.42 
 
 
263 aa  248  9e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2928  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  46.49 
 
 
270 aa  246  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1357  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  46.13 
 
 
270 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.540226  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0655  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  53.72 
 
 
259 aa  242  5e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2133  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  47.17 
 
 
270 aa  240  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000214154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  47.17 
 
 
270 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1935  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  46.82 
 
 
266 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988046  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1372  electron transfer flavoprotein beta-subunit  46.95 
 
 
263 aa  236  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.505758  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2776  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  46.27 
 
 
277 aa  236  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000336538  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2258  electron transfer flavoprotein subunit beta  45.22 
 
 
271 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00448777  hitchhiker  0.0000000000493094 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0683  electron transfer flavoprotein subunit beta  45.79 
 
 
272 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0348502  normal  0.693464 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0130  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  48.11 
 
 
263 aa  235  6e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.999111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1211  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.02 
 
 
270 aa  235  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2067  electron transfer flavoprotein subunit beta  46.49 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107752  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2872  electron transfer flavoprotein  44.28 
 
 
270 aa  231  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.604288  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1500  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  46.49 
 
 
270 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0572  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.59 
 
 
271 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2716  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  46.13 
 
 
270 aa  229  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0367  electron transfer flavoprotein beta-subunit  47.84 
 
 
262 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969021  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2416  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.39 
 
 
270 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2787  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.02 
 
 
270 aa  228  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1466  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.65 
 
 
270 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  46.31 
 
 
610 aa  226  2e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1480  electron transfer flavoprotein, beta subunit  48.59 
 
 
280 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1196  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  48.59 
 
 
280 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2797  electron transfer flavoprotein, beta subunit  49 
 
 
272 aa  225  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000537457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2267  electron transfer flavoprotein subunit beta  46.51 
 
 
283 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0956  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.97 
 
 
281 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.660702  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1368  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  47.95 
 
 
283 aa  221  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1355  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  47.15 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000258852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0142  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  47.35 
 
 
282 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7739  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.65 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1436  electron transfer flavoprotein subunit beta FixA  44.28 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000812152  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3596  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.78 
 
 
278 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1193  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.49 
 
 
285 aa  216  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.40527  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1262  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  45.49 
 
 
285 aa  215  5e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2313  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.91 
 
 
282 aa  215  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.842048  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.53 
 
 
601 aa  213  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10520  Electron transfer flavoprotein beta-subunit, FixA  43.54 
 
 
281 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0308  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  43.94 
 
 
262 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4448  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.51 
 
 
294 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0984  electron transfer flavoprotein subunit beta  44.66 
 
 
298 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.892412  normal  0.0549625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1088  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.38 
 
 
281 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.44815  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0303  electron transfer flavoprotein, beta subunit  43.56 
 
 
262 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5086  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.51 
 
 
281 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.865111  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5872  protein fixA  44.24 
 
 
281 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0352817  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4929  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.49 
 
 
282 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1555  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.75 
 
 
284 aa  206  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0538091  normal  0.961972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1603  electron transfer flavoprotein beta-subunit  47.25 
 
 
335 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00422679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3577  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  46.53 
 
 
284 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161962  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1315  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.86 
 
 
262 aa  205  7e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.820816  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.67 
 
 
284 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6228  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.9 
 
 
295 aa  202  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0487  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.49 
 
 
284 aa  203  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0777  electron transfer flavoprotein, beta subunit  45.28 
 
 
288 aa  198  9e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3616  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  46.12 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.093225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4015  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.9 
 
 
284 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3687  electron transfer flavoprotein beta-subunit  42.02 
 
 
265 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0646  electron transfer flavoprotein beta-subunit  41.85 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413124  hitchhiker  0.00160368 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2371  electron transfer flavoprotein beta-subunit  41.85 
 
 
264 aa  176  3e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.829288  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.3 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2133  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.37 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  40.97 
 
 
259 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2200  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  41.77 
 
 
259 aa  168  7e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1998  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.64 
 
 
266 aa  168  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  39.21 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0540  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.54 
 
 
589 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.448343  normal  0.108603 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1233  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.13 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  38.43 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0477  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.78 
 
 
288 aa  160  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000602402  decreased coverage  0.000244781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0256  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.94 
 
 
259 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0672629  normal  0.0851543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1835  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.08 
 
 
257 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.163048  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0684  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.89 
 
 
260 aa  156  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.965438 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28260  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.51 
 
 
261 aa  155  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2099  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.43 
 
 
263 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4259  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.43 
 
 
263 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0655  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36.53 
 
 
258 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8114  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.44 
 
 
259 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1297  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  39.65 
 
 
259 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2299  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.64 
 
 
258 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3697  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39 
 
 
256 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.264298  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1815  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.21 
 
 
266 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.48954  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3659  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.3 
 
 
261 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1870  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.14 
 
 
266 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1850  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.14 
 
 
266 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1916  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.14 
 
 
266 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0359178  normal  0.444862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  35.8 
 
 
259 aa  148  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0640  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.58 
 
 
266 aa  148  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09600  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.07 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0670453  normal  0.0687461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1074  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.3 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250999  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3166  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.84 
 
 
258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>