More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0635 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  100 
 
 
610 aa  1224    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  70.43 
 
 
601 aa  870    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0540  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.65 
 
 
589 aa  338  9.999999999999999e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.448343  normal  0.108603 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  44.92 
 
 
442 aa  280  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  43.6 
 
 
341 aa  278  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  44.55 
 
 
443 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.87 
 
 
441 aa  273  9e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.45 
 
 
452 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.45 
 
 
452 aa  270  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.83 
 
 
441 aa  270  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.14 
 
 
340 aa  268  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.67 
 
 
439 aa  267  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.73 
 
 
436 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.79 
 
 
410 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.43 
 
 
442 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  42.2 
 
 
448 aa  264  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2086  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.17 
 
 
436 aa  262  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.14 
 
 
443 aa  260  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.67 
 
 
447 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.75 
 
 
397 aa  255  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.43 
 
 
447 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6229  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.95 
 
 
370 aa  252  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7738  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.88 
 
 
374 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0342501  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0476  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.36 
 
 
350 aa  252  2e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000313809  decreased coverage  0.000297308 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.73 
 
 
346 aa  251  2e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.65 
 
 
428 aa  250  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1195  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.13 
 
 
364 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.58 
 
 
399 aa  249  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1479  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.13 
 
 
364 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1435  electron transfer flavoprotein fixB (alpha subunit)  39.09 
 
 
367 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000130268  normal  0.0153048 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2372  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.12 
 
 
346 aa  248  2e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1194  electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.24 
 
 
338 aa  248  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1261  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  44.24 
 
 
338 aa  247  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  41.54 
 
 
439 aa  248  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5871  protein FixB  41.89 
 
 
368 aa  247  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  39.34 
 
 
335 aa  247  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  39.34 
 
 
335 aa  247  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0645  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.02 
 
 
345 aa  247  6e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.229702  hitchhiker  0.000990499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3615  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.12 
 
 
368 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0544664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0488  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.77 
 
 
370 aa  246  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.72 
 
 
399 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3576  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.12 
 
 
369 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.846794  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2314  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.88 
 
 
371 aa  244  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.261239  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1936  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  40.49 
 
 
441 aa  244  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.993938  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.67 
 
 
334 aa  242  1e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.27 
 
 
368 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10530  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, FixB  40.12 
 
 
360 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291846  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0141  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.62 
 
 
369 aa  243  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4014  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.41 
 
 
663 aa  241  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.797538  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1554  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.64 
 
 
364 aa  239  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243155  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1369  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.62 
 
 
374 aa  239  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5047  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.76 
 
 
375 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1089  electron transfer flavoprotein beta-subunit  41.34 
 
 
368 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419334  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  42.16 
 
 
339 aa  236  7e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4447  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.82 
 
 
369 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2266  electron transfer flavoprotein  40.42 
 
 
365 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0957  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.12 
 
 
342 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.5 
 
 
325 aa  233  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0583  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.94 
 
 
341 aa  232  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3597  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.09 
 
 
342 aa  232  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.01 
 
 
326 aa  230  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1372  electron transfer flavoprotein beta-subunit  42.59 
 
 
263 aa  228  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.505758  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0058  electron transfer flavoprotein subunit beta  46.01 
 
 
267 aa  226  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1880  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  46.31 
 
 
262 aa  226  7e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.190196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0985  electron transfer flavoprotein subunit beta  41.03 
 
 
367 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4928  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.21 
 
 
370 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1997  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.56 
 
 
352 aa  224  3e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2776  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.75 
 
 
277 aa  224  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000336538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0309  electron transfer flavoprotein, alpha subunit/FixB family protein  35.75 
 
 
397 aa  224  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1193  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  46.62 
 
 
285 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.40527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1211  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.3 
 
 
270 aa  223  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0368  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.05 
 
 
338 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1077  electron transfer flavoprotein, beta subunit  48.9 
 
 
261 aa  221  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1500  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.13 
 
 
270 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20554  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1262  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  46.26 
 
 
285 aa  221  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1316  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.04 
 
 
401 aa  221  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.08 
 
 
329 aa  221  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2716  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.75 
 
 
270 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1357  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.21 
 
 
270 aa  220  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.540226  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0304  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.04 
 
 
397 aa  220  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.27 
 
 
329 aa  220  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2928  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.21 
 
 
270 aa  220  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2067  electron transfer flavoprotein subunit beta  42.53 
 
 
270 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107752  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0131  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.62 
 
 
333 aa  218  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1545  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  48.68 
 
 
261 aa  218  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1480  electron transfer flavoprotein, beta subunit  43.89 
 
 
280 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2872  electron transfer flavoprotein  41.54 
 
 
270 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.604288  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1196  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.89 
 
 
280 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317392 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  39.01 
 
 
317 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2298  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.85 
 
 
328 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1436  electron transfer flavoprotein subunit beta FixA  42.86 
 
 
282 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000812152  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1368  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.91 
 
 
283 aa  213  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2313  electron transfer flavoprotein beta-subunit  41.67 
 
 
282 aa  213  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.842048  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2285  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.63 
 
 
259 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1608  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.93 
 
 
263 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2583  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  47.56 
 
 
259 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2133  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.08 
 
 
270 aa  212  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000214154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0572  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.06 
 
 
271 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2258  electron transfer flavoprotein subunit beta  41.22 
 
 
271 aa  210  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00448777  hitchhiker  0.0000000000493094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3167  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.85 
 
 
328 aa  209  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144656  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>