More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2266 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2266  electron transfer flavoprotein  100 
 
 
365 aa  744    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  73.1 
 
 
368 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4447  electron transfer flavoprotein beta-subunit  73.52 
 
 
369 aa  544  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1089  electron transfer flavoprotein beta-subunit  72.42 
 
 
368 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419334  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0141  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.67 
 
 
369 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0985  electron transfer flavoprotein subunit beta  72.7 
 
 
367 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5871  protein FixB  72.14 
 
 
368 aa  528  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3615  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.76 
 
 
368 aa  509  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0544664 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1554  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.13 
 
 
364 aa  506  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243155  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3576  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.22 
 
 
369 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.846794  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1195  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  68.04 
 
 
364 aa  501  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0488  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  70.67 
 
 
370 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1479  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  68.04 
 
 
364 aa  501  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6229  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.01 
 
 
370 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1435  electron transfer flavoprotein fixB (alpha subunit)  63.09 
 
 
367 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000130268  normal  0.0153048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4014  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.35 
 
 
663 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.797538  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5047  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.45 
 
 
375 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7738  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.64 
 
 
374 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0342501  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2314  electron transfer flavoprotein beta-subunit  62.57 
 
 
371 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.261239  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10530  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, FixB  63.61 
 
 
360 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291846  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4928  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.9 
 
 
370 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1369  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.73 
 
 
374 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  51.79 
 
 
447 aa  361  9e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  51.79 
 
 
447 aa  361  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  51.55 
 
 
428 aa  360  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  49.4 
 
 
441 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  50.46 
 
 
441 aa  345  8e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  49.85 
 
 
341 aa  342  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  51.08 
 
 
436 aa  343  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  48.94 
 
 
452 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  49.69 
 
 
443 aa  339  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  49.54 
 
 
340 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  47.16 
 
 
448 aa  336  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  48.63 
 
 
452 aa  336  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  46.76 
 
 
443 aa  333  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  48.09 
 
 
439 aa  333  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  49.39 
 
 
442 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  47.62 
 
 
442 aa  329  6e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2086  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  50.46 
 
 
436 aa  326  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3597  electron transfer flavoprotein alpha subunit  51.35 
 
 
342 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0957  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  52.28 
 
 
342 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  48.39 
 
 
439 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.65 
 
 
410 aa  315  8e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1936  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  45.59 
 
 
441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.993938  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  44.11 
 
 
335 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  44.11 
 
 
335 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.38 
 
 
399 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.26 
 
 
397 aa  276  3e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2199  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.19 
 
 
347 aa  275  7e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.94 
 
 
399 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  41.87 
 
 
339 aa  268  1e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.11 
 
 
334 aa  267  2e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0583  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.07 
 
 
341 aa  259  4e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1261  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  47.38 
 
 
338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.6 
 
 
335 aa  259  6e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1194  electron transfer flavoprotein alpha subunit  47.38 
 
 
338 aa  259  7e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0309  electron transfer flavoprotein, alpha subunit/FixB family protein  40.3 
 
 
397 aa  255  9e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0645  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.79 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.229702  hitchhiker  0.000990499 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0476  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.09 
 
 
350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000313809  decreased coverage  0.000297308 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2372  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.66 
 
 
346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0304  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40 
 
 
397 aa  252  6e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0368  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.76 
 
 
338 aa  252  7e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.31 
 
 
346 aa  250  3e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.42 
 
 
610 aa  235  8e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1836  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.24 
 
 
325 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0730508  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0131  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.4 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.84 
 
 
329 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0776  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.35 
 
 
339 aa  230  3e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1316  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.54 
 
 
401 aa  229  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.67 
 
 
328 aa  229  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.23 
 
 
329 aa  228  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.31 
 
 
601 aa  227  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2298  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.27 
 
 
328 aa  226  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.37 
 
 
326 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.76 
 
 
325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.21 
 
 
325 aa  219  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  37.77 
 
 
317 aa  219  6e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480174  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3167  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.37 
 
 
328 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144656  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1997  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.39 
 
 
352 aa  209  7e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3686  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.99 
 
 
348 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35 
 
 
317 aa  199  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4277  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.32 
 
 
342 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1857  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.36 
 
 
330 aa  186  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.519797  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.67 
 
 
320 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.35 
 
 
320 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.33 
 
 
325 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.15 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1816  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.67 
 
 
317 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.93 
 
 
327 aa  173  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.33 
 
 
329 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.85 
 
 
325 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3825  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.13 
 
 
317 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.194441  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3332  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.44 
 
 
317 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1269  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.46 
 
 
316 aa  169  7e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.877633 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  32.72 
 
 
325 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.72 
 
 
325 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  32.72 
 
 
325 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.72 
 
 
325 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.03 
 
 
325 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.94 
 
 
325 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>