More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7738 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7738  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  100 
 
 
374 aa  768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0342501  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1435  electron transfer flavoprotein fixB (alpha subunit)  80.16 
 
 
367 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000130268  normal  0.0153048 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2314  electron transfer flavoprotein beta-subunit  79.66 
 
 
371 aa  587  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.261239  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1369  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.59 
 
 
374 aa  515  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1195  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.74 
 
 
364 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1479  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.74 
 
 
364 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2266  electron transfer flavoprotein  63.11 
 
 
365 aa  462  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10530  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, FixB  63.71 
 
 
360 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291846  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0141  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.17 
 
 
369 aa  455  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.46 
 
 
368 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3576  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.36 
 
 
369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.846794  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5871  protein FixB  65.59 
 
 
368 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1089  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.31 
 
 
368 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419334  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0985  electron transfer flavoprotein subunit beta  63.2 
 
 
367 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4447  electron transfer flavoprotein beta-subunit  61.94 
 
 
369 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0488  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.58 
 
 
370 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1554  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.1 
 
 
364 aa  439  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243155  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3615  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.35 
 
 
368 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0544664 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5047  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.21 
 
 
375 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6229  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.86 
 
 
370 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4014  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.45 
 
 
663 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.797538  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4928  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.88 
 
 
370 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.94 
 
 
452 aa  364  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.24 
 
 
441 aa  363  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.47 
 
 
441 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.88 
 
 
340 aa  361  9e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  54.22 
 
 
341 aa  360  3e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  53.98 
 
 
442 aa  359  5e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.35 
 
 
436 aa  358  8e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.03 
 
 
452 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  51.66 
 
 
428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  52.27 
 
 
448 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.71 
 
 
439 aa  354  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.41 
 
 
442 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  51 
 
 
447 aa  352  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  51.3 
 
 
443 aa  352  7e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2086  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.78 
 
 
436 aa  348  6e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.25 
 
 
447 aa  347  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  51.53 
 
 
443 aa  346  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0957  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.01 
 
 
342 aa  344  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3597  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.7 
 
 
342 aa  342  7e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  52.25 
 
 
439 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  47.37 
 
 
410 aa  322  9.000000000000001e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1936  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  47.43 
 
 
441 aa  315  8e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.993938  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  45.71 
 
 
346 aa  296  3e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1261  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  52.73 
 
 
338 aa  293  3e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1194  electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.73 
 
 
338 aa  293  4e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0645  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  47.31 
 
 
345 aa  292  8e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.229702  hitchhiker  0.000990499 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2372  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  47.01 
 
 
346 aa  287  2e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  46.15 
 
 
335 aa  286  4e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  46.15 
 
 
335 aa  286  4e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0476  electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.31 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000313809  decreased coverage  0.000297308 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.51 
 
 
399 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  45.43 
 
 
339 aa  281  1e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.81 
 
 
397 aa  280  3e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  45.53 
 
 
399 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0368  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.28 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2199  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.37 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.94 
 
 
334 aa  263  4e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0583  electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.24 
 
 
341 aa  261  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.04 
 
 
335 aa  260  3e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1836  electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.68 
 
 
325 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0730508  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0131  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.98 
 
 
333 aa  257  3e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1997  electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.79 
 
 
352 aa  256  5e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.88 
 
 
610 aa  251  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0304  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.41 
 
 
397 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0776  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.79 
 
 
339 aa  246  6.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0309  electron transfer flavoprotein, alpha subunit/FixB family protein  40.73 
 
 
397 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.2 
 
 
328 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.39 
 
 
601 aa  242  7.999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.81 
 
 
329 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2298  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.25 
 
 
328 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.51 
 
 
329 aa  236  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1316  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.3 
 
 
401 aa  233  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.18 
 
 
325 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3167  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.87 
 
 
328 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144656  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.56 
 
 
326 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.47 
 
 
325 aa  227  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  38.59 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480174  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.15 
 
 
317 aa  219  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3686  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.27 
 
 
348 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1857  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.58 
 
 
330 aa  197  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.519797  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.46 
 
 
325 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.26 
 
 
320 aa  192  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.41 
 
 
320 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.77 
 
 
325 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.12 
 
 
329 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3825  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.09 
 
 
317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.194441  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  38.32 
 
 
317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1269  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.77 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.877633 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3332  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.42 
 
 
317 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.15 
 
 
327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1388  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.09 
 
 
317 aa  182  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.6 
 
 
325 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  35.6 
 
 
325 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.91 
 
 
325 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.6 
 
 
325 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.6 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.6 
 
 
325 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.29 
 
 
325 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>