More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0957 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0957  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
342 aa  686    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3597  electron transfer flavoprotein alpha subunit  92.69 
 
 
342 aa  626  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10530  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, FixB  55.79 
 
 
360 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.91 
 
 
441 aa  364  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.85 
 
 
443 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.05 
 
 
452 aa  362  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  54.01 
 
 
448 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1195  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.76 
 
 
364 aa  361  8e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1479  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.76 
 
 
364 aa  361  8e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7738  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.01 
 
 
374 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0342501  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.75 
 
 
452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  53.87 
 
 
443 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2314  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.56 
 
 
371 aa  355  8.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.261239  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  51.8 
 
 
441 aa  354  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1435  electron transfer flavoprotein fixB (alpha subunit)  56.35 
 
 
367 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000130268  normal  0.0153048 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  55.08 
 
 
341 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  52.92 
 
 
442 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.27 
 
 
447 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.01 
 
 
447 aa  348  8e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  52.89 
 
 
340 aa  347  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.68 
 
 
439 aa  344  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.8 
 
 
436 aa  343  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.37 
 
 
442 aa  342  7e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5871  protein FixB  52.89 
 
 
368 aa  342  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.41 
 
 
428 aa  342  8e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2266  electron transfer flavoprotein  52.28 
 
 
365 aa  341  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1089  electron transfer flavoprotein beta-subunit  54.13 
 
 
368 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419334  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3576  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.88 
 
 
369 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.846794  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  49.53 
 
 
410 aa  335  5.999999999999999e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4447  electron transfer flavoprotein beta-subunit  52.44 
 
 
369 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  51.71 
 
 
439 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1369  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.29 
 
 
374 aa  333  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3615  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.15 
 
 
368 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0544664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4014  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  51.61 
 
 
663 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.797538  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1936  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  49.7 
 
 
441 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.993938  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0985  electron transfer flavoprotein subunit beta  53.21 
 
 
367 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  51.99 
 
 
368 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0141  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.65 
 
 
369 aa  328  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6229  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  53.25 
 
 
370 aa  326  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2086  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.5 
 
 
436 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1554  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.65 
 
 
364 aa  324  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243155  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0488  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.29 
 
 
370 aa  324  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5047  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.78 
 
 
375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  48.33 
 
 
335 aa  306  3e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  48.33 
 
 
335 aa  306  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.04 
 
 
399 aa  305  7e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1261  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  53.42 
 
 
338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1194  electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.42 
 
 
338 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4928  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  50.15 
 
 
370 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0583  electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.65 
 
 
341 aa  298  1e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  48.14 
 
 
339 aa  295  7e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  47.45 
 
 
335 aa  294  2e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2372  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  48.48 
 
 
346 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0645  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.97 
 
 
345 aa  282  6.000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.229702  hitchhiker  0.000990499 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  45.54 
 
 
346 aa  279  5e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.48 
 
 
399 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1316  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.53 
 
 
401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0476  electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.2 
 
 
350 aa  272  8.000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000313809  decreased coverage  0.000297308 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0309  electron transfer flavoprotein, alpha subunit/FixB family protein  43.25 
 
 
397 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0304  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.87 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  43.61 
 
 
317 aa  264  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480174  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.34 
 
 
334 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.14 
 
 
329 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0368  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.72 
 
 
338 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.38 
 
 
397 aa  259  4e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2199  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.92 
 
 
347 aa  259  6e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.9 
 
 
329 aa  252  7e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0776  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.01 
 
 
339 aa  250  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.3 
 
 
326 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.12 
 
 
610 aa  249  7e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.15 
 
 
328 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.33 
 
 
601 aa  246  4.9999999999999997e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.36 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1836  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.2 
 
 
325 aa  242  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0730508  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0131  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.39 
 
 
333 aa  232  8.000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1997  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.9 
 
 
352 aa  230  3e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2298  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.61 
 
 
328 aa  229  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3167  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.61 
 
 
328 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144656  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3686  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.18 
 
 
348 aa  219  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.34 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.7 
 
 
325 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.3 
 
 
325 aa  210  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  38.3 
 
 
325 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.3 
 
 
325 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.3 
 
 
325 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.3 
 
 
325 aa  209  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.21 
 
 
325 aa  209  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.99 
 
 
325 aa  209  8e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.99 
 
 
325 aa  209  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.99 
 
 
325 aa  209  8e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.99 
 
 
325 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.99 
 
 
325 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.7 
 
 
325 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1857  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.42 
 
 
330 aa  205  9e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.519797  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  39.38 
 
 
317 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.96 
 
 
317 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1816  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.73 
 
 
317 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378347  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.65 
 
 
325 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3700  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.56 
 
 
327 aa  192  9e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768904  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.63 
 
 
318 aa  189  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>