More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6229 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_6229  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  100 
 
 
370 aa  757    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5047  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  78.9 
 
 
375 aa  557  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4928  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  75.55 
 
 
370 aa  544  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3576  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.74 
 
 
369 aa  531  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.846794  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0141  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  69.4 
 
 
369 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4447  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.93 
 
 
369 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5871  protein FixB  72.65 
 
 
368 aa  518  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1089  electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.59 
 
 
368 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419334  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  70.59 
 
 
368 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4014  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  71.23 
 
 
663 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.797538  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0985  electron transfer flavoprotein subunit beta  69.64 
 
 
367 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3615  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  69.43 
 
 
368 aa  495  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0544664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0488  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  70.52 
 
 
370 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1554  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.62 
 
 
364 aa  485  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243155  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2266  electron transfer flavoprotein  66.86 
 
 
365 aa  484  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10530  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, FixB  62.57 
 
 
360 aa  435  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291846  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1479  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.33 
 
 
364 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1369  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  60 
 
 
374 aa  430  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1435  electron transfer flavoprotein fixB (alpha subunit)  60.62 
 
 
367 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000130268  normal  0.0153048 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1195  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.33 
 
 
364 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7738  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.86 
 
 
374 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0342501  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2314  electron transfer flavoprotein beta-subunit  58.24 
 
 
371 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.261239  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  52.66 
 
 
341 aa  344  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  48.91 
 
 
428 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  50.46 
 
 
441 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  51.38 
 
 
436 aa  333  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  49.26 
 
 
441 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  49.7 
 
 
447 aa  332  5e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  50.61 
 
 
340 aa  331  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  50.46 
 
 
442 aa  331  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  49.39 
 
 
443 aa  329  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  49.55 
 
 
447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  47.92 
 
 
452 aa  325  9e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  49.1 
 
 
439 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2086  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  51.84 
 
 
436 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  47.62 
 
 
452 aa  323  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  47.01 
 
 
448 aa  322  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  48.8 
 
 
442 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  49.23 
 
 
443 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3597  electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.32 
 
 
342 aa  315  7e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0957  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.25 
 
 
342 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  46.54 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1936  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  47.59 
 
 
441 aa  305  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.993938  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.05 
 
 
410 aa  299  7e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  45.85 
 
 
335 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  45.85 
 
 
335 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  47.02 
 
 
399 aa  278  8e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.11 
 
 
346 aa  263  3e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2372  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.48 
 
 
346 aa  263  3e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0645  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.9 
 
 
345 aa  263  4e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.229702  hitchhiker  0.000990499 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.56 
 
 
397 aa  261  1e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.22 
 
 
334 aa  259  4e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0476  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.06 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000313809  decreased coverage  0.000297308 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.95 
 
 
610 aa  252  7e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.25 
 
 
399 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2199  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.87 
 
 
347 aa  246  3e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0309  electron transfer flavoprotein, alpha subunit/FixB family protein  37.99 
 
 
397 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0304  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.99 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1261  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  44.83 
 
 
338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1194  electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.83 
 
 
338 aa  243  5e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  39.7 
 
 
339 aa  242  7.999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0583  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.37 
 
 
341 aa  242  7.999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0776  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.47 
 
 
339 aa  241  1e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.25 
 
 
601 aa  239  4e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.08 
 
 
335 aa  239  8e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0131  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.52 
 
 
333 aa  239  8e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.88 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.69 
 
 
329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.35 
 
 
325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0368  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.31 
 
 
338 aa  225  8e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.39 
 
 
325 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  38.41 
 
 
317 aa  224  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480174  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1836  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.55 
 
 
325 aa  223  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0730508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1316  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.94 
 
 
401 aa  223  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1997  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.81 
 
 
352 aa  223  3e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.34 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2298  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.27 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.69 
 
 
328 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3167  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.58 
 
 
328 aa  209  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144656  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3686  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.07 
 
 
348 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.82 
 
 
329 aa  185  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.67 
 
 
320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1857  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.56 
 
 
330 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.519797  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.78 
 
 
320 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.25 
 
 
317 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1269  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.73 
 
 
316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.877633 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3332  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.36 
 
 
317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.13 
 
 
325 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3825  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.95 
 
 
317 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.194441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.64 
 
 
325 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1816  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.94 
 
 
317 aa  169  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378347  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3700  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.14 
 
 
327 aa  169  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768904  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.87 
 
 
317 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.53 
 
 
325 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2355  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.7 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.35 
 
 
317 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.93 
 
 
325 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  32.93 
 
 
325 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.93 
 
 
325 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0540  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.63 
 
 
589 aa  166  8e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.448343  normal  0.108603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>