More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1248 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  70.43 
 
 
610 aa  870    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
601 aa  1218    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0540  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.83 
 
 
589 aa  322  9.999999999999999e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.448343  normal  0.108603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.11 
 
 
340 aa  281  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  45.34 
 
 
441 aa  277  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  45.96 
 
 
443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  44.27 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.9 
 
 
410 aa  275  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.72 
 
 
441 aa  273  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.56 
 
 
443 aa  267  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  43.17 
 
 
448 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.5 
 
 
452 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  41.38 
 
 
341 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.8 
 
 
452 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.64 
 
 
436 aa  260  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.36 
 
 
447 aa  259  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.86 
 
 
439 aa  259  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.55 
 
 
442 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.67 
 
 
447 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.92 
 
 
428 aa  258  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2086  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.96 
 
 
436 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.95 
 
 
334 aa  253  6e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  41.67 
 
 
439 aa  250  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1435  electron transfer flavoprotein fixB (alpha subunit)  39.7 
 
 
367 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000130268  normal  0.0153048 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.18 
 
 
397 aa  246  6.999999999999999e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7738  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.39 
 
 
374 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0342501  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.68 
 
 
325 aa  241  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6229  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.25 
 
 
370 aa  239  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.58 
 
 
399 aa  239  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0141  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.69 
 
 
369 aa  239  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.04 
 
 
399 aa  239  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  40.06 
 
 
335 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  40.06 
 
 
335 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1195  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.48 
 
 
364 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1479  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.48 
 
 
364 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2314  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.09 
 
 
371 aa  238  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.261239  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5871  protein FixB  40 
 
 
368 aa  238  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1261  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  43.17 
 
 
338 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1194  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.17 
 
 
338 aa  236  6e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0476  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.15 
 
 
350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000313809  decreased coverage  0.000297308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4014  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.4 
 
 
663 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.797538  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10530  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, FixB  39.17 
 
 
360 aa  235  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291846  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0645  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.59 
 
 
345 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.229702  hitchhiker  0.000990499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0957  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.33 
 
 
342 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3597  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.33 
 
 
342 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2372  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.11 
 
 
346 aa  234  5e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0583  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.25 
 
 
341 aa  233  7.000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.74 
 
 
346 aa  233  9e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1089  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.19 
 
 
368 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419334  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5047  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.68 
 
 
375 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.77 
 
 
368 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3576  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.56 
 
 
369 aa  231  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.846794  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1554  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.94 
 
 
364 aa  231  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243155  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4447  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.06 
 
 
369 aa  230  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1372  electron transfer flavoprotein beta-subunit  46.61 
 
 
263 aa  229  8e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.505758  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1936  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  38.44 
 
 
441 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.993938  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.62 
 
 
326 aa  228  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0985  electron transfer flavoprotein subunit beta  40.19 
 
 
367 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0488  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.09 
 
 
370 aa  228  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1369  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.25 
 
 
374 aa  227  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2266  electron transfer flavoprotein  37.31 
 
 
365 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3615  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.82 
 
 
368 aa  223  6e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0544664 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0304  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.06 
 
 
397 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4928  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.64 
 
 
370 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2199  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.14 
 
 
347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0131  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.25 
 
 
333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0309  electron transfer flavoprotein, alpha subunit/FixB family protein  37.35 
 
 
397 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36.76 
 
 
339 aa  219  7.999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1368  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  48.1 
 
 
283 aa  219  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.5 
 
 
317 aa  216  8e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2313  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.12 
 
 
282 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.842048  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1880  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  46.53 
 
 
262 aa  213  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.190196 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1480  electron transfer flavoprotein, beta subunit  45.85 
 
 
280 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1196  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.85 
 
 
280 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0368  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.3 
 
 
338 aa  213  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0058  electron transfer flavoprotein subunit beta  44.44 
 
 
267 aa  212  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001045 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1436  electron transfer flavoprotein subunit beta FixA  44.72 
 
 
282 aa  211  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000812152  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.12 
 
 
335 aa  210  6e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.39 
 
 
329 aa  210  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.46 
 
 
329 aa  210  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1193  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.98 
 
 
285 aa  209  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.40527  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1545  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  43.08 
 
 
261 aa  209  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1316  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.87 
 
 
401 aa  208  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1538  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.73 
 
 
265 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.374456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3700  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.68 
 
 
327 aa  207  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768904  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1262  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  43.61 
 
 
285 aa  207  4e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.59 
 
 
328 aa  206  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  36.94 
 
 
317 aa  206  7e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480174  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0776  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.54 
 
 
339 aa  206  8e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1077  electron transfer flavoprotein, beta subunit  46.7 
 
 
261 aa  205  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210239 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1935  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  41.89 
 
 
266 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988046  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7739  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.87 
 
 
282 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0584  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.95 
 
 
260 aa  204  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4448  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.8 
 
 
294 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2285  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.63 
 
 
259 aa  203  8e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2776  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.55 
 
 
277 aa  203  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000336538  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.54 
 
 
325 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2298  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.75 
 
 
328 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0142  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.54 
 
 
282 aa  200  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2583  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  43.24 
 
 
259 aa  200  6e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>