More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4277 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4277  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
342 aa  704    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.27 
 
 
326 aa  222  9e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.65 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.58 
 
 
410 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.51 
 
 
441 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0583  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.4 
 
 
341 aa  207  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  36.17 
 
 
335 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  36.17 
 
 
335 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  32.33 
 
 
442 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3167  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.81 
 
 
328 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144656  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.85 
 
 
447 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.72 
 
 
452 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.53 
 
 
439 aa  202  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.54 
 
 
447 aa  202  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  31 
 
 
443 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.23 
 
 
439 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.13 
 
 
442 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.61 
 
 
340 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  32.72 
 
 
448 aa  200  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.02 
 
 
443 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.21 
 
 
441 aa  198  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.16 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.45 
 
 
329 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2298  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.97 
 
 
328 aa  196  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.4 
 
 
399 aa  193  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  32.61 
 
 
341 aa  192  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.2 
 
 
436 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2086  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.13 
 
 
436 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2266  electron transfer flavoprotein  32.32 
 
 
365 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.15 
 
 
329 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3597  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.89 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1936  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.35 
 
 
441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.993938  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.66 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.54 
 
 
329 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.77 
 
 
317 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.75 
 
 
399 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.12 
 
 
428 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0131  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.33 
 
 
333 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2372  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.04 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.73 
 
 
318 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1435  electron transfer flavoprotein fixB (alpha subunit)  33.82 
 
 
367 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000130268  normal  0.0153048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10530  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, FixB  30.4 
 
 
360 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291846  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0645  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.26 
 
 
345 aa  178  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.229702  hitchhiker  0.000990499 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.83 
 
 
334 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.1 
 
 
339 aa  177  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2314  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.54 
 
 
371 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.261239  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0957  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.76 
 
 
342 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1369  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.55 
 
 
374 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7738  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.51 
 
 
374 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0342501  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0488  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.6 
 
 
370 aa  175  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.85 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4258  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.86 
 
 
318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.83 
 
 
346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3700  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.68 
 
 
327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768904  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2199  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31 
 
 
347 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.5 
 
 
368 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1195  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.43 
 
 
364 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1479  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.43 
 
 
364 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.57 
 
 
317 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0065  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.71 
 
 
320 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.777154  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28250  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.13 
 
 
319 aa  170  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3576  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.74 
 
 
369 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.846794  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3259  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.83 
 
 
317 aa  169  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0049  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  35.1 
 
 
321 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0053  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.31 
 
 
320 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.44 
 
 
325 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.33 
 
 
325 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.92 
 
 
320 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3686  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.93 
 
 
348 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0476  electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.23 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000313809  decreased coverage  0.000297308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1089  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.16 
 
 
368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419334  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.72 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.51 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  32.72 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.72 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  32.72 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2520  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.29 
 
 
304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.72 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  32.72 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.72 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.85 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1836  electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.19 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0730508  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4447  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.87 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.72 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3615  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.99 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0544664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1851  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.43 
 
 
318 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.404972  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1554  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.18 
 
 
364 aa  164  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243155  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1871  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.43 
 
 
318 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1917  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.43 
 
 
318 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.638543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1857  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.41 
 
 
330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.519797  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.72 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3825  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.42 
 
 
317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.194441  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  33.03 
 
 
318 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0985  electron transfer flavoprotein subunit beta  31.58 
 
 
367 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4014  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  29.88 
 
 
663 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.797538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.44 
 
 
317 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.91 
 
 
397 aa  161  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3759  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.68 
 
 
321 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0995938  hitchhiker  0.00147037 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  31.4 
 
 
317 aa  160  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>