More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1608 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1608  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  100 
 
 
263 aa  532  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1372  electron transfer flavoprotein beta-subunit  51 
 
 
263 aa  267  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.505758  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0058  electron transfer flavoprotein subunit beta  48.69 
 
 
267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1880  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  49.42 
 
 
262 aa  248  9e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.190196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1211  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.63 
 
 
270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1545  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  46.09 
 
 
261 aa  236  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1538  electron transfer flavoprotein beta-subunit  47.69 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.374456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2285  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.38 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2583  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  45.38 
 
 
259 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1935  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  46.92 
 
 
266 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988046  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2258  electron transfer flavoprotein subunit beta  44.15 
 
 
271 aa  232  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00448777  hitchhiker  0.0000000000493094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2716  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.45 
 
 
270 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2776  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.27 
 
 
277 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000336538  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1500  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.08 
 
 
270 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2133  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.77 
 
 
270 aa  229  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000214154 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0308  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  43.68 
 
 
262 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.77 
 
 
270 aa  229  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2928  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.18 
 
 
270 aa  228  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1357  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.18 
 
 
270 aa  228  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.540226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2872  electron transfer flavoprotein  45.04 
 
 
270 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.604288  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1077  electron transfer flavoprotein, beta subunit  44.53 
 
 
261 aa  226  3e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210239 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1193  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.49 
 
 
285 aa  223  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.40527  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0303  electron transfer flavoprotein, beta subunit  42.91 
 
 
262 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2067  electron transfer flavoprotein subunit beta  43.94 
 
 
270 aa  222  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107752  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1088  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.28 
 
 
281 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.44815  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0984  electron transfer flavoprotein subunit beta  42.54 
 
 
298 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.892412  normal  0.0549625 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1262  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  45.11 
 
 
285 aa  221  8e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5086  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.48 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.865111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2416  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.73 
 
 
270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4448  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.66 
 
 
294 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5872  protein fixA  42.26 
 
 
281 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0352817  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0683  electron transfer flavoprotein subunit beta  43.02 
 
 
272 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0348502  normal  0.693464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2267  electron transfer flavoprotein subunit beta  42.86 
 
 
283 aa  217  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2313  electron transfer flavoprotein beta-subunit  42.16 
 
 
282 aa  216  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.842048  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1480  electron transfer flavoprotein, beta subunit  44.96 
 
 
280 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0142  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.65 
 
 
282 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1196  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.96 
 
 
280 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0572  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.23 
 
 
271 aa  216  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1485  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.69 
 
 
262 aa  215  5.9999999999999996e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0507333  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0367  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.73 
 
 
262 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969021  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0130  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  48.28 
 
 
263 aa  215  5.9999999999999996e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.999111  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1368  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.27 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1315  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.75 
 
 
262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.820816  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.93 
 
 
610 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3616  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.75 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.093225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0487  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.54 
 
 
284 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10520  Electron transfer flavoprotein beta-subunit, FixA  42.48 
 
 
281 aa  212  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1436  electron transfer flavoprotein subunit beta FixA  42.16 
 
 
282 aa  211  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000812152  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1466  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.44 
 
 
270 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2787  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.06 
 
 
270 aa  208  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.04 
 
 
284 aa  207  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7739  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.54 
 
 
282 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3577  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.26 
 
 
284 aa  205  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161962  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4015  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.01 
 
 
284 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4929  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.91 
 
 
282 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1555  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.95 
 
 
284 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0538091  normal  0.961972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0956  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.38 
 
 
281 aa  198  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.660702  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3596  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.35 
 
 
278 aa  198  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1603  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.45 
 
 
335 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00422679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2797  electron transfer flavoprotein, beta subunit  41.13 
 
 
272 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000537457  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.05 
 
 
601 aa  190  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6228  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.42 
 
 
295 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1355  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  43.02 
 
 
269 aa  183  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000258852  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0584  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.18 
 
 
260 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0540  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.54 
 
 
589 aa  179  4e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.448343  normal  0.108603 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0655  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  45.65 
 
 
259 aa  177  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2299  electron transfer flavoprotein beta-subunit  41.7 
 
 
258 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  41.67 
 
 
259 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8114  electron transfer flavoprotein beta-subunit  41.67 
 
 
259 aa  175  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673435 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3166  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.93 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0256  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.85 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0672629  normal  0.0851543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  38.04 
 
 
259 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  40.52 
 
 
259 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1835  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.52 
 
 
257 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.163048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3687  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.35 
 
 
265 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0412  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.92 
 
 
259 aa  168  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.80435  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.5 
 
 
260 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1297  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  40.35 
 
 
259 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0777  electron transfer flavoprotein, beta subunit  40.55 
 
 
288 aa  159  5e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28260  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.56 
 
 
261 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0477  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.94 
 
 
288 aa  155  8e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000602402  decreased coverage  0.000244781 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1438  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  39.04 
 
 
260 aa  155  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0597474  normal  0.920137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1074  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.32 
 
 
280 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250999  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0684  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.39 
 
 
260 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.965438 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1233  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.89 
 
 
262 aa  149  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0646  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.77 
 
 
264 aa  146  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413124  hitchhiker  0.00160368 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2133  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.4 
 
 
264 aa  146  3e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3659  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.84 
 
 
261 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2200  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  37.83 
 
 
259 aa  145  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1103  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.68 
 
 
259 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0274897  normal  0.0559611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1210  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.53 
 
 
259 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4092  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  35.09 
 
 
259 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1998  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.85 
 
 
266 aa  142  4e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3260  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.44 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3679  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  34.57 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1815  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.33 
 
 
266 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.48954  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2371  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.03 
 
 
264 aa  138  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.829288  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3697  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.66 
 
 
256 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.264298  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.77 
 
 
259 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2266  electron transfer flavoprotein subunit beta  34.46 
 
 
260 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0330642  hitchhiker  0.0000280428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>