More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4132 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4132  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  905    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1785  hypothetical protein  46.42 
 
 
459 aa  342  8e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211733  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0206  hypothetical protein  38.68 
 
 
466 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  38.46 
 
 
451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6231  hypothetical protein  39.81 
 
 
445 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3755  amidohydrolase  38.79 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8698  amidohydrolase  40 
 
 
428 aa  249  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7586  hypothetical protein  39.26 
 
 
456 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4435  amidohydrolase  34.97 
 
 
451 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0048  amidohydrolase  34.02 
 
 
501 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2025  amidohydrolase  34.79 
 
 
504 aa  204  4e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4067  amidohydrolase  36.16 
 
 
461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.737174  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1947  amidohydrolase  33.92 
 
 
466 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2471  amidohydrolase  32.96 
 
 
480 aa  194  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356182  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3049  amidohydrolase  36.03 
 
 
414 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4731  amidohydrolase  33.97 
 
 
490 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2899  amidohydrolase  33.63 
 
 
482 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39910  metal dependent hydrolase  33.03 
 
 
520 aa  147  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.776901  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5508  hypothetical protein  29.47 
 
 
451 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5157  amidohydrolase  30.28 
 
 
487 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4218  amidohydrolase  32.58 
 
 
466 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2253  amidohydrolase  27.78 
 
 
437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.77 
 
 
447 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03928  hydrolase transmembrane protein  27.76 
 
 
476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0597256 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08593  chlorohydrolase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00460)  28.12 
 
 
465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  28.76 
 
 
455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  27.67 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  25.92 
 
 
434 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.25 
 
 
441 aa  117  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.09 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31 
 
 
449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.09 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31 
 
 
449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  26.38 
 
 
440 aa  113  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  25.23 
 
 
428 aa  114  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.88 
 
 
470 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.86 
 
 
465 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  27.25 
 
 
447 aa  113  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  27.06 
 
 
431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.08 
 
 
470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  28.77 
 
 
445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.73 
 
 
469 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.42 
 
 
470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.54 
 
 
470 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  26.36 
 
 
462 aa  110  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.2 
 
 
470 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.12 
 
 
465 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.81 
 
 
453 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  24.08 
 
 
420 aa  108  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.2 
 
 
470 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.07 
 
 
461 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.47 
 
 
451 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  27.75 
 
 
430 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.02 
 
 
500 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.02 
 
 
476 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  25.5 
 
 
435 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  25.5 
 
 
435 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.02 
 
 
476 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15770  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.43 
 
 
445 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3159  amidohydrolase  27.51 
 
 
447 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0462314 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  30.12 
 
 
460 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  24.56 
 
 
433 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  28.25 
 
 
443 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  25.28 
 
 
435 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0863  amidohydrolase  28.22 
 
 
509 aa  103  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  0.0227657 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  23.16 
 
 
432 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1736  amidohydrolase  24.42 
 
 
455 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  25.28 
 
 
435 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.38 
 
 
452 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  25.28 
 
 
435 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  25.28 
 
 
435 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.15 
 
 
444 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  27 
 
 
462 aa  101  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6206  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.53 
 
 
452 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.32 
 
 
445 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6058  amidohydrolase  26.54 
 
 
479 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535728  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1810  amidohydrolase  27.86 
 
 
473 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.5 
 
 
454 aa  100  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  25.28 
 
 
435 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.67 
 
 
454 aa  100  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  25.28 
 
 
435 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.02 
 
 
443 aa  100  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.28 
 
 
458 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  24.83 
 
 
435 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.56 
 
 
446 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  24.94 
 
 
441 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  31.29 
 
 
444 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4071  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.59 
 
 
455 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00785709  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.34 
 
 
451 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1577  amidohydrolase  26.51 
 
 
466 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  28.1 
 
 
453 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.15 
 
 
444 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4734  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.63 
 
 
455 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1728  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  23.6 
 
 
452 aa  97.1  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  27.29 
 
 
478 aa  96.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.47 
 
 
455 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.47 
 
 
451 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  26.87 
 
 
428 aa  96.3  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7136  amidohydrolase  28.44 
 
 
461 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17350  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  28.36 
 
 
528 aa  96.3  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0530405  normal  0.112875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>