27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4075 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4075  cytochrome c, class I  100 
 
 		 139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3250  hypothetical protein  41.51 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0156  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.417204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2652  hypothetical protein  41.82 
 
 		 161 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4367  hypothetical protein  39.64 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3822  hypothetical protein  37.06 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0562  cytochrome c, class I  34.93 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  35.24 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  35.24 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2220  hypothetical protein  35.14 
 
 		 172 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.785493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 183 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  33.04 
 
 		 182 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  33.04 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1690  cytochrome c, class I  40 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15604  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  32.38 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  34.69 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.485186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0038  putative cytochrome c-552  36.3 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277554  normal  0.0180936 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  32.2 
 
 		 146 aa  50.8  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2338  hypothetical protein  27.27 
 
 		 168 aa  50.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  27.5 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  30.51 
 
 		 232 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  31.82 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  37.25 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  44.44 
 
 		 221 aa  40.8  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0781  cytochrome c family protein  35.06 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>