More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3891 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1099  propionyl-CoA carboxylase  78.83 
 
 		 515 aa  834    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3891  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 533 aa  1085    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3419  Propionyl-CoA carboxylase  79.42 
 
 		 515 aa  855    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0831  propionyl-CoA carboxylase  74.56 
 
 		 514 aa  793    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3097  propionyl-CoA carboxylase  56.07 
 
 		 518 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2593  propionyl-CoA carboxylase  57 
 
 		 505 aa  597  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3945  Propionyl-CoA carboxylase  57.31 
 
 		 519 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1854  propionyl-CoA carboxylase  57.8 
 
 		 505 aa  579  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3573  putative methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  57.14 
 
 		 519 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1979  propionyl-CoA carboxylase  43.69 
 
 		 518 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  33.73 
 
 		 531 aa  282  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  33.46 
 
 		 517 aa  279  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  33 
 
 		 516 aa  274  4.0000000000000004e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  31.94 
 
 		 531 aa  272  9e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  34.03 
 
 		 520 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  32.3 
 
 		 514 aa  272  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  31.9 
 
 		 516 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  34.21 
 
 		 514 aa  269  8e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  33.4 
 
 		 525 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  34.03 
 
 		 519 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  34.03 
 
 		 519 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  31.84 
 
 		 522 aa  263  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  32.25 
 
 		 518 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  33.82 
 
 		 519 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  32.09 
 
 		 516 aa  260  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  33.2 
 
 		 508 aa  259  1e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  33.33 
 
 		 514 aa  257  5e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  33.81 
 
 		 517 aa  256  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  33.33 
 
 		 538 aa  254  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  32.92 
 
 		 516 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  31.14 
 
 		 516 aa  253  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  32.58 
 
 		 510 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6502  carboxyl transferase  34.35 
 
 		 529 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838117  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  32.86 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  32.87 
 
 		 522 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  32.37 
 
 		 520 aa  251  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  32.39 
 
 		 530 aa  251  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  30.77 
 
 		 512 aa  251  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  34.27 
 
 		 532 aa  250  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  32.72 
 
 		 510 aa  250  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  32.58 
 
 		 510 aa  249  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  30.36 
 
 		 523 aa  249  8e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  32.58 
 
 		 510 aa  249  8e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  28.02 
 
 		 515 aa  249  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  32.72 
 
 		 550 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  32.58 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  31.91 
 
 		 510 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  30.43 
 
 		 516 aa  246  8e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  32.99 
 
 		 518 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  32.17 
 
 		 510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  33.2 
 
 		 510 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  30.65 
 
 		 517 aa  244  3.9999999999999997e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  31.94 
 
 		 536 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  32.48 
 
 		 516 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  31.42 
 
 		 510 aa  243  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  30.16 
 
 		 512 aa  243  7e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  31.24 
 
 		 514 aa  243  7.999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2019  propionyl-CoA carboxylase  34.07 
 
 		 498 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  31.49 
 
 		 510 aa  243  9e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  31.1 
 
 		 513 aa  242  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  32.87 
 
 		 510 aa  242  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  30.92 
 
 		 513 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  31.74 
 
 		 510 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  31.33 
 
 		 510 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  31.73 
 
 		 520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  30.56 
 
 		 528 aa  239  8e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  30.52 
 
 		 515 aa  239  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  30.94 
 
 		 510 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0718  carboxyl transferase  32.72 
 
 		 510 aa  239  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.267542  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  29.41 
 
 		 508 aa  238  2e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  31.35 
 
 		 534 aa  238  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  31.09 
 
 		 516 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  31.8 
 
 		 515 aa  238  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  31.05 
 
 		 510 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  32.72 
 
 		 516 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  30.19 
 
 		 514 aa  238  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  30.93 
 
 		 517 aa  237  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  30.91 
 
 		 510 aa  238  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  30.19 
 
 		 514 aa  237  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  34.1 
 
 		 514 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  28.57 
 
 		 516 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  31.49 
 
 		 523 aa  236  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1099  propionyl-CoA carboxylase  30.33 
 
 		 535 aa  236  7e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  30.92 
 
 		 510 aa  236  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  31.35 
 
 		 521 aa  236  7e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  31.99 
 
 		 510 aa  236  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  32.22 
 
 		 516 aa  236  9e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  31.9 
 
 		 510 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1754  carboxyl transferase  32.39 
 
 		 510 aa  236  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.218371  normal  0.119502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  32.06 
 
 		 510 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1215  methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  33.47 
 
 		 519 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.336846  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  31.44 
 
 		 510 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  32.52 
 
 		 530 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  31.32 
 
 		 522 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  31.56 
 
 		 529 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  30.74 
 
 		 510 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  31.39 
 
 		 510 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  31.19 
 
 		 510 aa  234  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  31.08 
 
 		 510 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  31.43 
 
 		 510 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>