78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2672 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2672  amidinotransferase  100 
 
 
296 aa  607  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0585  amidinotransferase  81.16 
 
 
292 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3467  amidinotransferase  52.5 
 
 
294 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.501017  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  38.83 
 
 
703 aa  188  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  38.57 
 
 
704 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  38.46 
 
 
705 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  37.73 
 
 
705 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  37.73 
 
 
705 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  37.86 
 
 
703 aa  179  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  37.14 
 
 
703 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1814  amidinotransferase family protein  32.75 
 
 
275 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0382  amidinotransferase family protein  32.39 
 
 
275 aa  169  6e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0222666  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1169  amidinotransferase  37 
 
 
278 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.730709  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  36.5 
 
 
680 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2147  amidinotransferase  37.73 
 
 
278 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3814  amidinotransferase  36.63 
 
 
285 aa  142  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0780  amidinotransferase  36.82 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  34.53 
 
 
269 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2664  amidinotransferase  37.37 
 
 
273 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5070  amidinotransferase  33.46 
 
 
281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1011  amidinotransferase  35.13 
 
 
272 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34213  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1021  amidinotransferase  35.13 
 
 
272 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0993  amidinotransferase  35.13 
 
 
272 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  34.53 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12346  hypothetical protein  33.95 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  34.88 
 
 
296 aa  132  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2012  amidinotransferase  35.66 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0130  amidinotransferase  34.39 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2331  amidinotransferase  34.07 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1316  amidinotransferase  34.55 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1288  amidinotransferase  31.25 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.254269  normal  0.122965 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  33.33 
 
 
279 aa  125  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2244  amidinotransferase  36.86 
 
 
276 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.510972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6044  amidinotransferase  34.78 
 
 
271 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227436  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7970  amidinotransferase  34.07 
 
 
280 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30700  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  33.9 
 
 
279 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6661  amidinotransferase  34.56 
 
 
292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0754101  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0887  amidinotransferase  33.09 
 
 
272 aa  118  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.766224  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3304  amidinotransferase  32.53 
 
 
356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4529  amidinotransferase  32.85 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03350  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  30.71 
 
 
270 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5039  amidinotransferase  31.88 
 
 
277 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  23.26 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  26.34 
 
 
257 aa  59.3  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  25.61 
 
 
256 aa  58.9  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  23.77 
 
 
283 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  25.63 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5776  hypothetical protein  24.27 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  23.78 
 
 
294 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  25.2 
 
 
254 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05885  DdaH family protein  21.93 
 
 
304 aa  53.1  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.542101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  26.19 
 
 
253 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4639  amidinotransferase  24.37 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266629  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3320  dimethylargininase  25.1 
 
 
256 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1628  hypothetical protein  22.84 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3837  dimethylargininase  24.79 
 
 
252 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456176  normal  0.996067 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5166  amidinotransferase  25.78 
 
 
305 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2023  amidinotransferase family protein  24.32 
 
 
362 aa  49.3  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136244  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2143  dimethylargininase  23.95 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434845  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02830  uncharacterized conserved protein with pentein-type domain  24.34 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  22.8 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0193  hypothetical protein  25.77 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1622  hypothetical protein  21.98 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4521  amidinotransferase  24.91 
 
 
287 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  25.83 
 
 
261 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  22.78 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  22.22 
 
 
258 aa  47  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3194  amidinotransferase  22.89 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4635  amidinotransferase  26.05 
 
 
264 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.370008 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0020  amidinotransferase  25.93 
 
 
293 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289153 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  24.62 
 
 
271 aa  46.2  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2108  amidinotransferase  26.03 
 
 
323 aa  45.8  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3241  Dimethylargininase  25.58 
 
 
258 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3943  dimethylargininase  23.46 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444932  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4424  dimethylargininase  23.46 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2391  hypothetical protein  23.87 
 
 
305 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482221  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3585  dimethylargininase  23.46 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849367  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0365  pentein-type domain-containing protein  22.98 
 
 
311 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.529714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>