17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2722 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  100 
 
 		 497 aa  961    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2653  O-antigen polymerase  67.14 
 
 		 499 aa  584  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  40.43 
 
 		 1025 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0065  O-antigen polymerase  37.22 
 
 		 502 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  34.3 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2378  O-antigen polymerase  29.94 
 
 		 700 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.868657  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  27.34 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  23.44 
 
 		 470 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  27.14 
 
 		 532 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5482  hypothetical protein  29.02 
 
 		 545 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  24.49 
 
 		 457 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  24.49 
 
 		 457 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  27.42 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  26.57 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  24.02 
 
 		 781 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  23.08 
 
 		 496 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  25.23 
 
 		 467 aa  44.3  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>