More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1557 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  98.28 
 
 
581 aa  1192    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  100 
 
 
581 aa  1206    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  62.78 
 
 
570 aa  726    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1240  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  84.72 
 
 
580 aa  1022    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.37 
 
 
569 aa  600  1e-170  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.02 
 
 
569 aa  595  1e-169  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  52.5 
 
 
569 aa  596  1e-169  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0186  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.17 
 
 
576 aa  597  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  53.57 
 
 
581 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3108  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.34 
 
 
571 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0611  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  52.15 
 
 
589 aa  566  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.175913  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.84 
 
 
552 aa  566  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.1 
 
 
558 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.22 
 
 
565 aa  560  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.39 
 
 
563 aa  560  1e-158  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0171  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.57 
 
 
586 aa  560  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458212  normal  0.847135 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0706  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  54.28 
 
 
581 aa  559  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.27 
 
 
581 aa  560  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1906  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  51.04 
 
 
619 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365234  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1952  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  51.04 
 
 
619 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338885  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.3 
 
 
569 aa  556  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1886  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  51.04 
 
 
619 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0490387  normal  0.105007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1090  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  51.77 
 
 
598 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1123  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  50.35 
 
 
629 aa  554  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1335  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  51.74 
 
 
611 aa  553  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.552773 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.52 
 
 
566 aa  552  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.31 
 
 
566 aa  553  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.87 
 
 
566 aa  554  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1233  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  50.26 
 
 
627 aa  554  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506  normal  0.463621 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3125  acetolactate synthase, large subunit  51.54 
 
 
564 aa  554  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.65 
 
 
566 aa  555  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  51.22 
 
 
620 aa  552  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2122  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  50.95 
 
 
625 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522117  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  50.96 
 
 
588 aa  550  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  48.7 
 
 
566 aa  550  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.92 
 
 
559 aa  551  1e-155  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3392  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  50.52 
 
 
585 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13018  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  51.2 
 
 
618 aa  550  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0170383  normal  0.298126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4073  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.45 
 
 
623 aa  548  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24876  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18810  acetolactate synthase, large subunit  49.74 
 
 
585 aa  546  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.740593  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3640  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  50.41 
 
 
608 aa  545  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3230  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.23 
 
 
644 aa  545  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.65 
 
 
554 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  50.52 
 
 
597 aa  547  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.05 
 
 
563 aa  543  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  48.62 
 
 
577 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  48.78 
 
 
578 aa  542  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.86 
 
 
555 aa  538  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.74 
 
 
562 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7782  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  50.09 
 
 
586 aa  541  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  49.05 
 
 
567 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.13 
 
 
566 aa  537  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08530  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  50.17 
 
 
633 aa  535  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0564947  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.69 
 
 
659 aa  536  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10680  acetolactate synthase, large subunit  49.91 
 
 
626 aa  538  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.141846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.51 
 
 
553 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.05 
 
 
568 aa  537  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  49.82 
 
 
623 aa  536  1e-151  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.32 
 
 
556 aa  535  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8059  acetolactate synthase, large subunit  51.64 
 
 
578 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634605  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2386  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.7 
 
 
613 aa  532  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6021  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  50.52 
 
 
611 aa  534  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.6 
 
 
557 aa  532  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.96 
 
 
571 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.74 
 
 
557 aa  533  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1408  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  49.22 
 
 
623 aa  529  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.04 
 
 
573 aa  531  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.3 
 
 
571 aa  531  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.43 
 
 
555 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2539  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  50.26 
 
 
633 aa  529  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0377208  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.57 
 
 
569 aa  530  1e-149  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1319  acetolactate synthase catalytic subunit  49.39 
 
 
566 aa  528  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  49.74 
 
 
620 aa  529  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1717  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.17 
 
 
566 aa  527  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.589802  normal  0.264845 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2279  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  50.26 
 
 
635 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1710  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  49.38 
 
 
615 aa  525  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.53529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.7 
 
 
558 aa  528  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.26 
 
 
557 aa  528  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.78 
 
 
570 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.78 
 
 
570 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.96 
 
 
570 aa  525  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.46 
 
 
563 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.78 
 
 
570 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.66 
 
 
573 aa  522  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1909  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  47.59 
 
 
561 aa  523  1e-147  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000425472  hitchhiker  0.0000717525 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1517  acetolactate synthase catalytic subunit  48.68 
 
 
566 aa  518  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1308  acetolactate synthase catalytic subunit  48.68 
 
 
578 aa  518  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1281  acetolactate synthase catalytic subunit  48.68 
 
 
569 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1282  acetolactate synthase catalytic subunit  48.68 
 
 
566 aa  520  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1985  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.53 
 
 
568 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1417  acetolactate synthase catalytic subunit  48.68 
 
 
566 aa  518  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.54 
 
 
562 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1978  acetolactate synthase, large subunit  48.53 
 
 
568 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3894  acetolactate synthase catalytic subunit  48.51 
 
 
566 aa  521  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1556  acetolactate synthase catalytic subunit  48.86 
 
 
566 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3419  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.92 
 
 
579 aa  519  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130634  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1488  acetolactate synthase catalytic subunit  48.68 
 
 
569 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.78 
 
 
571 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1450  acetolactate synthase catalytic subunit  48.77 
 
 
566 aa  521  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.805223  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2168  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.08 
 
 
573 aa  521  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>