129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2746 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2746  putative lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 219 aa  443  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2575  SmpA/OmlA domain protein  84.93 
 
 		 218 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2985  SmpA/OmlA domain protein  84.47 
 
 		 218 aa  334  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2836  SmpA/OmlA  62.76 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0572  putative outer membrane lipoprotein  60.45 
 
 		 288 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1207  outer membrane lipoprotein, putatitve  67.23 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0374  SmpA/OmlA family lipoprotein  57.14 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3456  outer membrane lipoprotein, putatitve  65.29 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3384  SmpA/OmlA domain protein  62.6 
 
 		 276 aa  179  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148479 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2736  SmpA/OmlA domain-containing protein  64.66 
 
 		 273 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3419  SmpA/OmlA family lipoprotein  65.25 
 
 		 263 aa  177  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3454  SmpA/OmlA family lipoprotein  65.25 
 
 		 263 aa  177  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2644  SmpA/OmlA family lipoprotein  65.25 
 
 		 263 aa  177  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2457  outer membrane lipoprotein, putatitve  65.25 
 
 		 276 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1233  SmpA/OmlA family lipoprotein  65.25 
 
 		 279 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2975  SmpA/OmlA  67.83 
 
 		 258 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.977187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0571  SmpA/OmlA domain-containing protein  65.49 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.253801 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0545  SmpA/OmlA domain-containing protein  65.49 
 
 		 265 aa  175  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2592  SmpA/OmlA domain-containing protein  61.48 
 
 		 297 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116933 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0167  SmpA/OmlA  64.6 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0650  SmpA/OmlA domain-containing protein  64.6 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0617  SmpA/OmlA domain-containing protein  64.6 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3736  outer membrane lipoprotein, SmpA/OmlA  64.6 
 
 		 272 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1654  SmpA/OmlA  54.05 
 
 		 185 aa  168  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0252  SmpA/OmlA domain protein  45.73 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0407  SmpA/OmlA domain protein  48.18 
 
 		 186 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0754  SmpA/OmlA  50.81 
 
 		 170 aa  135  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1069  SmpA/OmlA domain-containing protein  45.21 
 
 		 199 aa  135  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6008  SmpA/OmlA domain-containing protein  47.48 
 
 		 193 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0230  SmpA/OmlA domain-containing protein  45.89 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0475  SmpA/OmlA domain-containing protein  50.82 
 
 		 182 aa  132  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4609  SmpA/OmlA  45.45 
 
 		 170 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4554  SmpA/OmlA domain-containing protein  46.43 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0222  small protein A (tmRNA-binding)-like protein  43.24 
 
 		 183 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3271  SmpA/OmlA domain protein  43.17 
 
 		 183 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3923  SmpA/OmlA domain-containing protein  42.45 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3790  SmpA/OmlA domain-containing protein  45.19 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1728  SmpA/OmlA domain protein  50 
 
 		 135 aa  115  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0935  SmpA/OmlA  48.28 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.970773 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0476  SmpA/OmlA  43.52 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3628  SmpA/OmlA domain-containing protein  36 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0759  SmpA/OmlA  34.59 
 
 		 175 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1195  SmpA/OmlA  33.33 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0776  SmpA/OmlA  34.62 
 
 		 281 aa  94  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.880566  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2737  small protein A (tmRNA-binding)-like  41.9 
 
 		 131 aa  93.2  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000974363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43020  outer membrane lipoprotein OmlA  46.61 
 
 		 171 aa  93.2  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  38.79 
 
 		 342 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5485  outer membrane lipoprotein OmlA  48.1 
 
 		 187 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4199  SmpA/OmlA  40.68 
 
 		 173 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4509  outer membrane lipoprotein OmlA  40.68 
 
 		 173 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0701  SmpA/OmlA domain-containing protein  40.35 
 
 		 178 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  hitchhiker  0.0000863527 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4731  SmpA/OmlA domain protein  45.57 
 
 		 178 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63030  outer membrane lipoprotein OmlA precursor  46.84 
 
 		 176 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4597  SmpA/OmlA domain-containing protein  45.57 
 
 		 178 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0944638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4732  SmpA/OmlA domain-containing protein  45.57 
 
 		 178 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1285  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.4 
 
 		 164 aa  86.3  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.522478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2385  small protein A  32.3 
 
 		 163 aa  85.5  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.750326  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1097  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.61 
 
 		 167 aa  85.1  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3098  SmpA/OmlA  37.84 
 
 		 143 aa  84  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0966  outer membrane lipoprotein  41.35 
 
 		 117 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2622  small protein A  37.86 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2949  SmpA/OmlA domain-containing protein  28.74 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1523  SmpA/OmlA domain-containing protein  32 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.512522  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1242  SmpA/OmlA  29.93 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.834375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1232  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.26 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2773  SmpA/OmlA domain-containing protein  28.14 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664934  normal  0.104565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2851  SmpA/OmlA domain-containing protein  28.14 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1310  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.45 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3049  SmpA/OmlA domain protein  29.79 
 
 		 177 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.331273  normal  0.468309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1301  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.45 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.84513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1337  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.45 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1476  small protein A  27.54 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0377  small protein A  33.59 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.861991  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1517  outer membrane protein  36.96 
 
 		 130 aa  74.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.718257  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1460  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.96 
 
 		 130 aa  74.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.708366  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1886  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.28 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2890  hypothetical protein  37.38 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000014061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1410  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.35 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1375  hypothetical protein  37.74 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233732  normal  0.0312807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2977  hypothetical protein  37.74 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140554  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1713  SmpA/OmlA  33.62 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2476  lipoprotein, small protein A  39.77 
 
 		 118 aa  71.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01128  hypothetical protein  42.39 
 
 		 119 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3687  hypothetical protein  35.85 
 
 		 112 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0028904  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004297  lipoprotein SmpA a component of the essential YaeT outer-membrane protein assembly complex  37.72 
 
 		 119 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1271  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.14 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175523  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3968  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.93 
 
 		 105 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2830  hypothetical protein  37.74 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.015187  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3012  hypothetical protein  37.74 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2898  hypothetical protein  37.74 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2880  hypothetical protein  37.74 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0290  SmpA/OmlA  29.6 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0676323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2900  hypothetical protein  37.74 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748981 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3826  SmpA/OmlA family protein  27.78 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336392  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0986  SmpA/OmlA domain protein  34.42 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0457  SmpA/OmlA domain protein  43.59 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0279  lipoprotein, SmpA/OmlA family  43.59 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0264  outer membrane lipoprotein OmlA  33 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.28381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2051  SmpA/OmlA domain protein  32.35 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2769  hypothetical protein  37.74 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0179366  normal  0.124588 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>