58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1922 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1922  tail formation-like protein  100 
 
 		 205 aa  413  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.857603  normal  0.409622 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1824  phage tail protein I  53.69 
 
 		 203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3036  tail protein I  57.84 
 
 		 203 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041286 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2762  phage tail protein I  54.5 
 
 		 201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00844  putative phage tail protein  54.5 
 
 		 201 aa  232  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00850  hypothetical protein  54.5 
 
 		 201 aa  232  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2093  phage tail protein I  53.92 
 
 		 203 aa  232  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2344  phage tail protein I  59.8 
 
 		 202 aa  230  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0939  phage tail protein I  54 
 
 		 201 aa  230  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3190  phage tail protein I  54.9 
 
 		 203 aa  228  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2851  phage tail protein I  54.5 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3485  phage tail protein I  59.8 
 
 		 202 aa  224  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.244882  normal  0.0401595 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3034  phage tail protein I  52.5 
 
 		 201 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  decreased coverage  0.00021132 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1385  Phage tail protein I  57.64 
 
 		 208 aa  216  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4340  phage tail protein GpI  58.76 
 
 		 176 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.025863 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2655  phage tail protein I  52.71 
 
 		 202 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.357141  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0763  tail protein I  50.75 
 
 		 204 aa  214  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3399  tail protein I  56.78 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3819  phage tail protein I  49.5 
 
 		 202 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4380  phage tail protein I  55.37 
 
 		 176 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.152838  hitchhiker  0.000126962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4043  phage tail protein I  51.74 
 
 		 202 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.00000000000078014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0866  phage tail protein I  53.71 
 
 		 1097 aa  198  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1940  phage tail protein I  54.29 
 
 		 176 aa  192  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08040  putative phage tail protein  45.45 
 
 		 177 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000518011  hitchhiker  0.000200901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37450  Phage P2 baseplate assembly gpI-like protein  45.66 
 
 		 266 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3303  phage tail protein I  38.2 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1138  phage-related tail protein  46.9 
 
 		 185 aa  114  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0399  phage-related tail protein  46.9 
 
 		 185 aa  114  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.75339  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1160  phage tail protein I  46.9 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1620  Bacteriophage P2-related tail formation protein-like protein  35 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160144  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2381  Phage tail protein I  40 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2766  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2899  phage tail protein I  41.53 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1290  Phage tail protein I  35.09 
 
 		 181 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.647737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2215  phage tail protein I  31.95 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448255  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0357  phage tail protein I  44.12 
 
 		 169 aa  99.4  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1334  phage-related tail protein  35.29 
 
 		 184 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01349  phage tail protein I  39.39 
 
 		 169 aa  96.3  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0890  phage tail protein I  38.85 
 
 		 433 aa  94.7  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0583  phage tail protein I  45.61 
 
 		 228 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92683  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3652  phage tail protein I  41.18 
 
 		 137 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0286259  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4852  phage tail protein I  35.12 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1142  Phage tail protein I  32 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2298  phage tail protein I  42.02 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396216  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0191  phage tail protein I  39.32 
 
 		 183 aa  87.8  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.726269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4134  phage tail protein I  39.17 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0690  Phage tail protein I  36.13 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1863  phage tail protein I  42.71 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3055  pyocin R2_PP, tail formation protein  36.36 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1208  phage tail protein I  35.58 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715514 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4956  phage tail protein I  29.92 
 
 		 158 aa  62  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0686  phage tail protein I  48.33 
 
 		 419 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0232  phage tail protein, putative  25.14 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114712  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4538  putative phage tail protein  25.95 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4453  putative phage tail protein  25.95 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4537  putative phage tail protein  25.95 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198534 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3392  hypothetical protein  26.01 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0741  Phage tail protein I  28.89 
 
 		 279 aa  45.1  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.463872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3330  Phage tail protein I  42.31 
 
 		 422 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>