30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1273 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1273  putative lipoprotein  100 
 
 		 282 aa  568  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.958512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1101  putative lipoprotein  86.52 
 
 		 280 aa  482  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1194  putative lipoprotein  86.22 
 
 		 280 aa  481  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2330  putative lipoprotein  47.33 
 
 		 244 aa  185  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0461141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3752  putative lipoprotein  48.16 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2411  hypothetical protein  46.09 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3486  putative lipoprotein  45.82 
 
 		 271 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2076  putative lipoprotein  44.27 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128092  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6128  putative lipoprotein  42.4 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0160  putative lipoprotein  47.15 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1964  putative lipoprotein  43.61 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0700691  hitchhiker  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1144  putative lipoprotein  41.09 
 
 		 258 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4640  putative lipoprotein  42.63 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2178  hypothetical protein  33.73 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1552  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.35 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0129  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.55 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.774772  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0131  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.55 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21780  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.03 
 
 		 242 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0247  hypothetical protein  46.81 
 
 		 241 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0750  2-phosphosulfolactate phosphatase  32.12 
 
 		 282 aa  52.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.158423  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1805  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.73 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191126  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1051  2-phosphosulfolactate phosphatase  23.91 
 
 		 241 aa  49.3  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00427368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0407  2-phosphosulfolactate phosphatase  23.77 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.932789  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1161  2-phosphosulfolactate phosphatase  24.78 
 
 		 248 aa  45.8  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.862609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06701  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.85 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.284053  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2823  2-phosphosulfolactate phosphatase  23.45 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1570  2-phosphosulfolactate phosphatase  29.8 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4549  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.99 
 
 		 236 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2138  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.59 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.506693  normal  0.243415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4415  2-phosphosulfolactate phosphatase  23.42 
 
 		 236 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587802  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>