More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0992 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  100 
 
 		 360 aa  739    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2501  glutathione S-transferase-like protein  77.44 
 
 		 360 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.919556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2340  glutathione S-transferase  76.34 
 
 		 272 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0809017  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7338  glutathione S-transferase-like protein  36.79 
 
 		 213 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0170  putative glutathione S-transferase  30.54 
 
 		 215 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5333  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.3 
 
 		 149 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51860  Glutathione S-transferase, N-terminal:Glutathione S-transferase, C-terminal  35.32 
 
 		 259 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  33.82 
 
 		 219 aa  99.8  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2192  activator of Hsp90 ATPase-like protein  34.03 
 
 		 157 aa  97.1  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4182  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 		 154 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0911379 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3201  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.06 
 
 		 180 aa  90.1  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1366  hypothetical protein  38.52 
 
 		 166 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0823  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.1 
 
 		 161 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.13 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.61 
 
 		 142 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.16 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3580  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.37 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0483717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.94 
 
 		 156 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2010  hypothetical protein  32.24 
 
 		 152 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.62 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  29.95 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  29.47 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2467  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.25 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0754  stringent starvation protein A  27.75 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00653635  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0940  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.06 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.85 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  28.86 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3198  stringent starvation protein A  32.35 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3664  stringent starvation protein A  27.65 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1042  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.15 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3304  stringent starvation protein A  32.56 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3640  stringent starvation protein A  28.82 
 
 		 212 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3535  stringent starvation protein A  28.82 
 
 		 212 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00187434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1140  activator of Hsp90 ATPase 1-like protein  30.15 
 
 		 144 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3533  stringent starvation protein A  28.82 
 
 		 212 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186075  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3702  stringent starvation protein A  28.82 
 
 		 212 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3605  stringent starvation protein A  28.82 
 
 		 212 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0584302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1157  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.15 
 
 		 144 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03089  stringent starvation protein A  29.41 
 
 		 212 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00148635  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0477  Glutathione S-transferase domain protein  29.41 
 
 		 212 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149407  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1167  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.15 
 
 		 144 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.957262  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4073  hypothetical protein  30.28 
 
 		 147 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3547  stringent starvation protein A  29.41 
 
 		 212 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000170112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3712  stringent starvation protein A  29.41 
 
 		 212 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3524  stringent starvation protein A  29.41 
 
 		 212 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.56 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.56 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4546  stringent starvation protein A  29.41 
 
 		 212 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3418  stringent starvation protein A  29.41 
 
 		 212 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  30.66 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0477  stringent starvation protein A  29.41 
 
 		 212 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000183333  normal  0.261267 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03040  hypothetical protein  29.41 
 
 		 212 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00103064  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.54 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3168  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.25 
 
 		 155 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.737433  hitchhiker  0.000398428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.99 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0557  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.88 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3018  stringent starvation protein A  32.35 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00907689  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4424  stringent starvation protein A  26.34 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339627  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.93 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411397  hitchhiker  0.000261904 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3795  stringent starvation protein A  27.07 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00599595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3637  stringent starvation protein A  27.68 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0301  stringent starvation protein A  28.49 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00830466  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  27.18 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0286  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.9 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0851  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.19 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451549 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1939  stringent starvation protein A  27.65 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0294  stringent starvation protein A  28.49 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0133166  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0254  stringent starvation protein A  27.65 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0916387  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2630  hypothetical protein  28.4 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0694  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.14 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280865 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2757  hypothetical protein  28.4 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1256  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.07 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0703772  normal  0.143196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  28.92 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0611  stringent starvation protein A  29.65 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4118  glutathione S-transferase  28.02 
 
 		 205 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  30 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0893  hypothetical protein  29.17 
 
 		 147 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  26.1 
 
 		 300 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  30.33 
 
 		 214 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4347  stringent starvation protein A  28.24 
 
 		 213 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000258123  hitchhiker  0.00803988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3273  stringent starvation protein A  31.4 
 
 		 209 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.42421  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3533  stringent starvation protein A  31.18 
 
 		 209 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0362173  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03200  stringent starvation protein A  28.57 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000139382  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  30.33 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.95 
 
 		 209 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57530  stringent starvation protein A  26.88 
 
 		 205 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2427  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.78 
 
 		 147 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5000  stringent starvation protein A  27.75 
 
 		 205 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0261594  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3760  stringent starvation protein A  31.76 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000134387  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6467  Glutathione S-transferase domain protein  31.63 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3703  stringent starvation protein A  31.76 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3160  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase C subunit  29.21 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.571951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0565  stringent starvation protein A  31.76 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000178546  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0707  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.2 
 
 		 146 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117656  hitchhiker  0.00673639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3886  stringent starvation protein A  31.76 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2543  hypothetical protein  28.97 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.689147  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3425  stringent starvation protein A  31.18 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0632774  normal  0.103062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0604  stringent starvation protein A  31.76 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.202043  hitchhiker  0.000247718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>