19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3854 on replicon NC_009007
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0773  hypothetical protein  42.65 
 
 		 1578 aa  720    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.981658  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3854  ICE nucleation protein  100 
 
 		 1561 aa  2588    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4068  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  98.78 
 
 		 1561 aa  2556    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.516852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  42.38 
 
 		 1809 aa  818    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3090  ice nucleation protein  41.93 
 
 		 519 aa  295  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1543 aa  285  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1821 aa  248  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1584 aa  211  6e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5533  hypothetical protein  37.91 
 
 		 996 aa  187  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1608  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1348 aa  94  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0984785 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24577  predicted protein  27.4 
 
 		 1676 aa  62.4  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0561517  normal  0.0448283 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02272  TAL effector AvrBs3/PthA  27.67 
 
 		 1107 aa  60.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05714  TAL effector AvrBs3/PthA  27.55 
 
 		 1483 aa  58.9  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0599163  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  24.88 
 
 		 631 aa  51.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00227  TAL effector AvrBs3/PthA  28.39 
 
 		 1267 aa  48.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.855849  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  34.24 
 
 		 1034 aa  48.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00505  TAL effector AvrBs3/PthA  28.44 
 
 		 653 aa  46.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.467766  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  30.58 
 
 		 3521 aa  45.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3717  hypothetical protein  34.48 
 
 		 600 aa  45.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.102425  normal  0.276356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>