28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_05714 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00572  TAL effector AvrBs3/PthA  91.39 
 
 		 1047 aa  1815    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06234  TAL effector AvrBs3/PthA  91.86 
 
 		 983 aa  1699    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00915225  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06229  TAL effector AvrBs3/PthA  92.6 
 
 		 904 aa  1579    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00614737  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05718  TAL effector AvrBs3/PthA  92.19 
 
 		 868 aa  1490    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000318376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05714  TAL effector AvrBs3/PthA  100 
 
 		 1483 aa  2912    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0599163  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05633  TAL effector AvrBs3/PthA  92.6 
 
 		 904 aa  1579    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00212942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05609  TAL effector AvrBs3/PthA  92.04 
 
 		 1017 aa  1740    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000182939  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03922  TAL effector AvrBs3/PthA  91.66 
 
 		 1037 aa  1757    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147648  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02272  TAL effector AvrBs3/PthA  89.15 
 
 		 1107 aa  1816    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02269  TAL effector AvrBs3/PthA  88.92 
 
 		 734 aa  1206    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.046405  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02172  TAL effector AvrBs3/PthA  88.2 
 
 		 1086 aa  1783    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01085  TAL effector AvrBs3/PthA  91.86 
 
 		 983 aa  1699    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000275966  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00567  TAL effector AvrBs3/PthA  93.04 
 
 		 810 aa  1439    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109196  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00546  TAL effector AvrBs3/PthA  92.6 
 
 		 969 aa  1680    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.1176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00511  TAL effector AvrBs3/PthA  90.97 
 
 		 623 aa  1096    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0108492  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00505  TAL effector AvrBs3/PthA  88.45 
 
 		 653 aa  1064    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.467766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00318  TAL effector AvrBs3/PthA  92.19 
 
 		 811 aa  1435    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.566935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00227  TAL effector AvrBs3/PthA  82.74 
 
 		 1267 aa  1801    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.855849  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00223  TAL effector AvrBs3/PthA  85.43 
 
 		 1068 aa  1416    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973214  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1815  hypothetical protein  47.52 
 
 		 1245 aa  562  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 		 1276 aa  76.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.66 
 
 		 1838 aa  63.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  20.75 
 
 		 1676 aa  60.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  22.17 
 
 		 1371 aa  58.9  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  26.72 
 
 		 1809 aa  55.5  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.58 
 
 		 1022 aa  54.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.45 
 
 		 988 aa  53.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  19.55 
 
 		 1534 aa  49.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>