26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00546 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00546  TAL effector AvrBs3/PthA  100 
 
 		 969 aa  1916    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.1176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05714  TAL effector AvrBs3/PthA  92.5 
 
 		 1483 aa  1684    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0599163  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05633  TAL effector AvrBs3/PthA  93.11 
 
 		 904 aa  1586    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00212942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05609  TAL effector AvrBs3/PthA  91.15 
 
 		 1017 aa  1748    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000182939  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03922  TAL effector AvrBs3/PthA  88.73 
 
 		 1037 aa  1732    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147648  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02272  TAL effector AvrBs3/PthA  89.25 
 
 		 1107 aa  1649    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02269  TAL effector AvrBs3/PthA  95.1 
 
 		 734 aa  1301    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.046405  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02172  TAL effector AvrBs3/PthA  94.34 
 
 		 1086 aa  1777    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01085  TAL effector AvrBs3/PthA  93.39 
 
 		 983 aa  1774    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000275966  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00572  TAL effector AvrBs3/PthA  92.65 
 
 		 1047 aa  1671    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00567  TAL effector AvrBs3/PthA  94.33 
 
 		 810 aa  1461    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109196  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00511  TAL effector AvrBs3/PthA  93.43 
 
 		 623 aa  1118    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0108492  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00505  TAL effector AvrBs3/PthA  91.37 
 
 		 653 aa  1081    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.467766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00318  TAL effector AvrBs3/PthA  93.46 
 
 		 811 aa  1457    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.566935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00227  TAL effector AvrBs3/PthA  92.24 
 
 		 1267 aa  1659    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.855849  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00223  TAL effector AvrBs3/PthA  88.89 
 
 		 1068 aa  1414    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973214  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05718  TAL effector AvrBs3/PthA  94.71 
 
 		 868 aa  1535    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000318376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06229  TAL effector AvrBs3/PthA  93.11 
 
 		 904 aa  1586    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00614737  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06234  TAL effector AvrBs3/PthA  93.39 
 
 		 983 aa  1774    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00915225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1815  hypothetical protein  43.84 
 
 		 1245 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 1371 aa  75.5  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  21.72 
 
 		 1276 aa  68.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.61 
 
 		 1838 aa  57  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1676 aa  55.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  19.72 
 
 		 1534 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.07 
 
 		 1343 aa  52.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>