21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1815 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1815  hypothetical protein  100 
 
 
1245 aa  2451    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02272  TAL effector AvrBs3/PthA  49.23 
 
 
1107 aa  571  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02172  TAL effector AvrBs3/PthA  44.93 
 
 
1086 aa  567  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06229  TAL effector AvrBs3/PthA  49.31 
 
 
904 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00614737  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00227  TAL effector AvrBs3/PthA  50.75 
 
 
1267 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.855849  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05714  TAL effector AvrBs3/PthA  47.88 
 
 
1483 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0599163  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05633  TAL effector AvrBs3/PthA  49.31 
 
 
904 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00212942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05609  TAL effector AvrBs3/PthA  48.77 
 
 
1017 aa  561  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000182939  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03922  TAL effector AvrBs3/PthA  47.37 
 
 
1037 aa  563  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147648  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00572  TAL effector AvrBs3/PthA  47.37 
 
 
1047 aa  560  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01085  TAL effector AvrBs3/PthA  42.83 
 
 
983 aa  558  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000275966  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06234  TAL effector AvrBs3/PthA  42.83 
 
 
983 aa  558  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00915225  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00546  TAL effector AvrBs3/PthA  47.99 
 
 
969 aa  545  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.1176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05718  TAL effector AvrBs3/PthA  49.74 
 
 
868 aa  541  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000318376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00318  TAL effector AvrBs3/PthA  50.42 
 
 
811 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.566935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00223  TAL effector AvrBs3/PthA  48.2 
 
 
1068 aa  514  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973214  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00567  TAL effector AvrBs3/PthA  50.14 
 
 
810 aa  509  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109196  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00505  TAL effector AvrBs3/PthA  52.84 
 
 
653 aa  483  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.467766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00511  TAL effector AvrBs3/PthA  49.61 
 
 
623 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0108492  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02269  TAL effector AvrBs3/PthA  48.72 
 
 
734 aa  437  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.046405  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  30.25 
 
 
1809 aa  50.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>