33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00567 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00546  TAL effector AvrBs3/PthA  94.33 
 
 		 969 aa  1462    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.1176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06234  TAL effector AvrBs3/PthA  92.7 
 
 		 983 aa  1474    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00915225  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06229  TAL effector AvrBs3/PthA  92.48 
 
 		 904 aa  1451    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00614737  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05718  TAL effector AvrBs3/PthA  90.76 
 
 		 868 aa  1450    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000318376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05714  TAL effector AvrBs3/PthA  93.04 
 
 		 1483 aa  1442    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0599163  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05633  TAL effector AvrBs3/PthA  92.48 
 
 		 904 aa  1451    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00212942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05609  TAL effector AvrBs3/PthA  93.43 
 
 		 1017 aa  1462    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000182939  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03922  TAL effector AvrBs3/PthA  90.88 
 
 		 1037 aa  1454    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147648  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02272  TAL effector AvrBs3/PthA  92.85 
 
 		 1107 aa  1444    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02269  TAL effector AvrBs3/PthA  94.12 
 
 		 734 aa  1286    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.046405  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02172  TAL effector AvrBs3/PthA  94.45 
 
 		 1086 aa  1485    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01085  TAL effector AvrBs3/PthA  92.7 
 
 		 983 aa  1474    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000275966  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00572  TAL effector AvrBs3/PthA  92.47 
 
 		 1047 aa  1431    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00567  TAL effector AvrBs3/PthA  100 
 
 		 810 aa  1605    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109196  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00511  TAL effector AvrBs3/PthA  88.6 
 
 		 623 aa  1055    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0108492  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00505  TAL effector AvrBs3/PthA  87.65 
 
 		 653 aa  955    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.467766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00318  TAL effector AvrBs3/PthA  93.59 
 
 		 811 aa  1455    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.566935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00227  TAL effector AvrBs3/PthA  91.62 
 
 		 1267 aa  1404    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.855849  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00223  TAL effector AvrBs3/PthA  92.91 
 
 		 1068 aa  1417    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973214  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1815  hypothetical protein  44.95 
 
 		 1245 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 1276 aa  88.6  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1676 aa  73.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  21.95 
 
 		 1371 aa  60.8  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.12 
 
 		 1838 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.6 
 
 		 1022 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  20.55 
 
 		 1534 aa  57.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.61 
 
 		 988 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  28.09 
 
 		 1809 aa  49.3  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 		 1054 aa  48.5  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1094 aa  48.1  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 		 3035 aa  47.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  20 
 
 		 706 aa  45.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  20.05 
 
 		 450 aa  44.3  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>