23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2990 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2990  hypothetical protein  100 
 
 		 1153 aa  2359    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1315  hypothetical protein  39.15 
 
 		 1221 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2085  hypothetical protein  39.15 
 
 		 1221 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1994  phage tail fiber protein  28.88 
 
 		 1564 aa  348  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38979  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3342  hypothetical protein  31.94 
 
 		 849 aa  293  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.696824  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0630  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1253 aa  285  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2232  Phage-related protein tail component-like protein  22.65 
 
 		 1915 aa  105  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  26.58 
 
 		 2400 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1874  hypothetical protein  25.49 
 
 		 885 aa  96.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1641  hypothetical protein  25.39 
 
 		 885 aa  95.5  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1830 aa  94.7  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  25.38 
 
 		 1093 aa  93.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  24.94 
 
 		 1093 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1315  hypothetical protein  23.04 
 
 		 702 aa  75.1  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3437  fibronectin type III domain-containing protein  23.69 
 
 		 1135 aa  62.4  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230863  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0256  fibronectin type III domain-containing protein  25.36 
 
 		 590 aa  53.5  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282629  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  23.75 
 
 		 934 aa  53.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  27.87 
 
 		 3521 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1004  hypothetical protein  24.4 
 
 		 680 aa  52.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0376  hypothetical protein  24.4 
 
 		 680 aa  52.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  25.27 
 
 		 3286 aa  52  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1267  hypothetical protein  40.3 
 
 		 694 aa  49.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  23.86 
 
 		 2900 aa  46.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>