49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1548 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  86.26 
 
 		 422 aa  722    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  99.76 
 
 		 441 aa  848    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  100 
 
 		 422 aa  850    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  66.51 
 
 		 420 aa  568  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  68.01 
 
 		 422 aa  555  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  68.26 
 
 		 420 aa  549  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  59.95 
 
 		 426 aa  495  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  60.66 
 
 		 425 aa  494  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  63.09 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  60.61 
 
 		 424 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  60.41 
 
 		 424 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  58.85 
 
 		 431 aa  483  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  55.77 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  56.44 
 
 		 475 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  56.88 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  55.15 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  57.63 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  54.48 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  53.63 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  49.88 
 
 		 420 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  49.88 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  55.12 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  52.23 
 
 		 428 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  55.12 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  55.12 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  54.69 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  54.42 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  53.54 
 
 		 445 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  53.49 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  42.32 
 
 		 486 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  39.32 
 
 		 428 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  39.56 
 
 		 482 aa  244  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  39.71 
 
 		 480 aa  242  7.999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  40.48 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  37.75 
 
 		 441 aa  233  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  39.27 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  39.68 
 
 		 407 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  38.26 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  37.16 
 
 		 410 aa  219  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  23.65 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  22.46 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  21.35 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  27.44 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0345  imelysin  24.54 
 
 		 359 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  21.49 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  21.75 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  31.4 
 
 		 356 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  22.89 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  23.68 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>