127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1331 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 		 127 aa  257  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  96.85 
 
 		 127 aa  249  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2600  flagellar basal body rod protein FlgB  75.59 
 
 		 127 aa  184  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2110  flagellar basal body rod protein FlgB  47.24 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.132503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3247  flagellar basal body rod protein FlgB  47.62 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2965  flagellar basal body rod protein FlgB  41.86 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.157354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  44.44 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  35.66 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  34.59 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1938  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.81 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  34.17 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0024  flagellar basal body rod protein FlgB  33.88 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1094  flagellar basal body rod protein FlgB  31.09 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2235  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.58 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0298  flagellar basal body rod protein FlgB  32.77 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1366  flagellar basal body rod protein FlgB  32.8 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3673  flagellar basal body rod protein FlgB  31.9 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1692  flagellar basal body rod protein FlgB  30.95 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315615  normal  0.0176326 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0317  flagellar basal body rod protein FlgB  27.73 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.763946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3437  putative flagellar basal-body rod protein FlgB  36.45 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0735  flagellar basal body rod protein FlgB  29.03 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1132  flagellar basal body rod protein FlgB  35.96 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3777  flagellar basal body rod protein FlgB  28.95 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5497  flagellar basal body rod protein FlgB  30.51 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  32.74 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  38.55 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1144  flagellar basal body rod protein FlgB  29.06 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.37 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0349  flagellar basal body rod protein FlgB  26.05 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1392  flagellar basal body rod protein FlgB  31.58 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154079  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0596  flagellar basal body rod protein FlgB  31.2 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.244257 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.33 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.65 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1693  flagellar basal body rod protein FlgB  28.07 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235256  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.41 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.05 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1212  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.35 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.856418  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.04 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3656  flagellar basal body rod protein FlgB  27.87 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.306825  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.59 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  35.29 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.46 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2831  flagellar basal body rod protein FlgB  29.32 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.159517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0618  flagellar basal body rod protein FlgB  30.71 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0896138  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2608  flagellar basal body rod protein FlgB  30.77 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0696754  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0629  flagellar basal body rod protein FlgB  30.71 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3954  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.44 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.64 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3578  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.62 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6142  flagellar basal body protein FlgB  39.51 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887047  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.36 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  32.8 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  32.8 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.8 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  32.8 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  32.8 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  32.8 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  32.8 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  32.8 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  32.8 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2638  flagellar basal body rod protein FlgB  29.06 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0151  flagellar basal body rod protein FlgB  28.7 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.31 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5971  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.73 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201131  normal  0.0194756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50480  flagellar basal body rod protein FlgB  39.08 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168653 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0237  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.07 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  41.67 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2134  flagellar basal body protein-like protein  30.33 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4212  flagellar basal body rod protein FlgB  28.7 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.74 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1755  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.73 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.28549 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.68 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  28.36 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0184  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.07 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  30.28 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4300  flagellar basal body rod protein FlgB  39.08 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  31.62 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0135  flagellar basal body rod protein FlgB  27.83 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  39.08 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.37 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0762  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.74 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.56 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  29.92 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  29.92 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  29.92 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  29.92 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  29.92 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  32.08 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.48 
 
 		 134 aa  42.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  32.08 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1645  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.87 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000413162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1906  flagellar basal body rod protein FlgB  32.73 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179452 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.34 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4251  flagellar basal body rod protein FlgB  41.51 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.03 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1517  flagellar basal body rod protein FlgB  33.61 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0183705  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  33.63 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1124  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.78 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0069  flagellar basal body rod protein FlgB  38.96 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>