177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05387 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05387  putative gluconate kinase protein  100 
 
 		 156 aa  314  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0327  carbohydrate kinase  44.24 
 
 		 167 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0956  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  40.83 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0046  carbohydrate kinase  37.11 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.324095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1876  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  34.57 
 
 		 182 aa  90.1  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.616409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2797  gluconate kinase  35.12 
 
 		 209 aa  89.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.654483  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2053  carbohydrate kinase  33.95 
 
 		 182 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402003  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2569  carbohydrate kinase  38.04 
 
 		 373 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00777638  hitchhiker  0.0000000380765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2785  carbohydrate kinase  34.97 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2524  carbohydrate kinase  34.36 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3337  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  36.42 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00678717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22480  gluconokinase  39.6 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3761  carbohydrate kinase  35.62 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117774  decreased coverage  0.00501521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3416  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  33.74 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0373306  normal  0.327266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2346  carbohydrate kinase  33.74 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5548  carbohydrate kinase  33.13 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34640  gluconokinase  34.55 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.425531  normal  0.105648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27310  gluconokinase  38 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3564  gluconokinase  35.9 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00350968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2939  gluconokinase  34.55 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1235  carbohydrate kinase  33.53 
 
 		 189 aa  73.9  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  27.16 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0316  carbohydrate kinase  36.18 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  31.48 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  29.01 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0904  gluconate kinase  30.67 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.119231  decreased coverage  0.0000000668063 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3028  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  30.9 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4336  gluconate kinase  32.16 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  31.13 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  33.12 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  31.33 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  35.98 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4650  gluconate kinase 1  32.73 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.648284 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  31.58 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3845  gluconate kinase 1  27.88 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.518112 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  30.63 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6161  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  40.7 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.28194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3943  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  28.76 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  29.38 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0926  gluconate kinase  31.72 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3722  gluconate kinase  34.09 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001959  gluconokinase  27.4 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3198  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  31.93 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000236698 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  30.32 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  29.27 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  29.27 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  29.27 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  32.26 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  30.12 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00513  gluconate kinase  26.14 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2732  gluconate kinase  30.6 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689831  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3742  gluconate kinase 1  26.79 
 
 		 186 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03288  gluconate kinase 2  26.67 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.609575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03241  hypothetical protein  26.67 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838554  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3888  gluconate kinase 1  26.67 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6828  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  30.87 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3636  gluconate kinase 1  26.67 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3915  gluconate kinase 1  26.67 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3720  gluconate kinase 1  26.67 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4753  gluconate kinase 1  26.67 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986563 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  31.85 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2070  carbohydrate kinase  31.87 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  29.38 
 
 		 759 aa  61.2  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  31.85 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  31.9 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0216  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  27.5 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3911  gluconate kinase 1  26.99 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.652303 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3045  carbohydrate kinase  32.12 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.383801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0352  thermoresistant gluconokinase  28.3 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.947295  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3661  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  37.41 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3851  gluconate kinase 1  26.99 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3809  gluconate kinase 1  26.99 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4870  D-gluconate kinase  24.69 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0564228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3731  gluconate kinase 1  26.99 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4497  gluconate kinase 1  28.75 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0404487 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0278  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  26.88 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4889  D-gluconate kinase  24.36 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4740  D-gluconate kinase  24.36 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0672986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4833  D-gluconate kinase  24.36 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  31.61 
 
 		 779 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0276  gluconate kinase 1  26.88 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4749  D-gluconate kinase  25.75 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4770  D-gluconate kinase  24.36 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.210509  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3529  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  25.64 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2577  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  25.64 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  26.44 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1469  thermosensitive gluconokinase  26.06 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  27.74 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  27.74 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  27.74 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  30.87 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0379  gluconate kinase  23.6 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127546  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  31.25 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  29.89 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  32.08 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0876  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  34.85 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.868196 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  29.17 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  29.17 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0625  carbohydrate kinase  29.38 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.207561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  31.48 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>