29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4097 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4097  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4250  hypothetical protein  65.29 
 
 		 290 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4923  putative exported protein of unknown function  58.11 
 
 		 247 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4278  hypothetical protein  48.18 
 
 		 227 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0679  hypothetical protein  77.42 
 
 		 200 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1193  hypothetical protein  45.99 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0587  hypothetical protein  78.81 
 
 		 208 aa  169  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.11001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6642  hypothetical protein  38.95 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.58 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2148  hypothetical protein  58.21 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.71 
 
 		 954 aa  62.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.89 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.42 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4979  hypothetical protein  35.79 
 
 		 179 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  31.96 
 
 		 153 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  31.96 
 
 		 153 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3779  hypothetical protein  30.93 
 
 		 136 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00992647  decreased coverage  0.000841718 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2165  hypothetical protein  32.99 
 
 		 208 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0898  hypothetical protein  32.99 
 
 		 208 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234161  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  30.93 
 
 		 136 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  31.58 
 
 		 136 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  30.93 
 
 		 153 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1813  hypothetical protein  33.68 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2232  hypothetical protein  32.26 
 
 		 159 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0807  hypothetical protein  31.96 
 
 		 208 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523267  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.21 
 
 		 232 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0353  hypothetical protein  28.12 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5049  CHAP domain containing protein  35.48 
 
 		 562 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2666  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31 
 
 		 224 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162936  normal  0.560234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>