46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3889 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3889  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0449106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4766  Methyltransferase type 11  70.48 
 
 		 210 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3407  hypothetical protein  70 
 
 		 218 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00706762  normal  0.230528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1337  hypothetical protein  64.32 
 
 		 225 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1387  methyltransferase type 11  40.43 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1306  hypothetical protein  32.89 
 
 		 251 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3216  hypothetical protein  27.98 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0455432  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2525  hypothetical protein  33.87 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0433419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4418  hypothetical protein  30.16 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4476  hypothetical protein  30.3 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0653  hypothetical protein  28.11 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2416  hypothetical protein  32.11 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715401  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0691  hypothetical protein  32.11 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1741  hypothetical protein  32.11 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1138  hypothetical protein  32.11 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1213  hypothetical protein  32.11 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0125495  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0777  hypothetical protein  36.47 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1724  hypothetical protein  27.17 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  34.65 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.88 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1135  hypothetical protein  32.41 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117463  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1397  hypothetical protein  34.07 
 
 		 212 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0635  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.29 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.312814 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33223  predicted protein  44 
 
 		 229 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0013315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  29.82 
 
 		 210 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1609  putative RNA methylase  30.3 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0178031  normal  0.513301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  27.05 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1709  SAM-binding motif-containing protein  32.35 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.39 
 
 		 449 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 226 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  38.6 
 
 		 463 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0365  putative RNA methylase  29.46 
 
 		 161 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  33.71 
 
 		 541 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4928  hypothetical protein  32.26 
 
 		 201 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0202  methyltransferase small  41.3 
 
 		 213 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2010  methyltransferase small  34.67 
 
 		 199 aa  42.7  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5006  predicted protein  41.38 
 
 		 270 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895863  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1326  methyltransferase  38 
 
 		 258 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0315  methyltransferase  32.26 
 
 		 202 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0437  hypothetical protein  30.11 
 
 		 202 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  29.07 
 
 		 255 aa  42.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1535  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  38 
 
 		 258 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000727979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0390  hypothetical protein  31.18 
 
 		 201 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1462  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38 
 
 		 258 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1352  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38 
 
 		 258 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>