28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1067 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1067  LRV FeS4 cluster  100 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0963  FeS4 cluster protein  90.94 
 
 		 265 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5107  LRV FeS4 cluster domain protein  83.21 
 
 		 261 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0115  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  57.32 
 
 		 259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0400  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  56.56 
 
 		 266 aa  280  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5900  hypothetical protein  59.43 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0217086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0208  leucine-rich repeat-containing protein  54.07 
 
 		 263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00966126  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3642  LRV FeS4 cluster domain protein  54.04 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1250  LRV FeS4 cluster domain protein  49.8 
 
 		 263 aa  230  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1534  leucine rich repeat protein  49.8 
 
 		 263 aa  230  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0996  leucine-rich repeat-containing protein  47.66 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1408  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  50.43 
 
 		 270 aa  212  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1242  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  48.5 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1449  hypothetical protein  47.68 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1578  leucine-rich repeat-containing protein  45.2 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0545  hypothetical protein  48.74 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0395  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  38.85 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2196  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  48.74 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0138  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  45 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3600  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  47.06 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643616  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2116  leucine-rich repeat-containing protein  45.61 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01440  Nitrogen fixing leucine rich variant repeat 4Fe-4S cluster protein  39.91 
 
 		 244 aa  139  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4007  LRV FeS4 cluster domain protein  43.43 
 
 		 211 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1574  LRV FeS4 cluster domain protein  41.8 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1408  leucine-rich repeat-containing protein  33.88 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.558669  normal  0.105067 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.95 
 
 		 1343 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  31.09 
 
 		 1345 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4105  leucine rich repeat variant  31.49 
 
 		 759 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.381637  normal  0.334817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>