122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0593 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 		 286 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3843  molybdenum storage protein beta subunit  90.37 
 
 		 270 aa  501  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0638  aspartate/glutamate/uridylate kinase  88.15 
 
 		 270 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1627  aspartate/glutamate/uridylate kinase  87.41 
 
 		 270 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2956  aspartate/glutamate/uridylate kinase  88.15 
 
 		 270 aa  488  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1574  aspartate/glutamate/uridylate kinase  86.99 
 
 		 270 aa  490  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1693  aspartate/glutamate/uridylate kinase  85.5 
 
 		 270 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43210  Molybdenum storage protein beta subunit, MosB  90.31 
 
 		 258 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0949  aspartate/glutamate/uridylate kinase  86.89 
 
 		 269 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.560652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0355  aspartate/glutamate/uridylate kinase  53.21 
 
 		 279 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0348  aspartate/glutamate/uridylate kinase  53.21 
 
 		 279 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2454  uridylate kinase  45.77 
 
 		 277 aa  245  6.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0354  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.97 
 
 		 277 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0347  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.97 
 
 		 277 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2394  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.38 
 
 		 276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0932  putative uridylate kinase  43.35 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1890  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.68 
 
 		 268 aa  210  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0277  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.07 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.366502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0516  aspartate/glutamate/uridylate kinase  45.23 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.316838  normal  0.700434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2386  uridylate kinase  42.15 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.802310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2625  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.78 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0024261  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2954  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.65 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0637  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.61 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1531  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.41 
 
 		 268 aa  192  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.215337  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.7 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.406129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3842  molybdenum storage protein alpha subunit  41.54 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1575  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.27 
 
 		 277 aa  188  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43200  Molybdenum storage protein subunit A  41.03 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0688  hypothetical protein  39.39 
 
 		 273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.512522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0592  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.3 
 
 		 276 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1694  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.63 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1626  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.3 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  30.05 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  26.75 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  33.01 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5909  uridylate kinase  29.52 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.166242  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1902  uridylate kinase  31.19 
 
 		 239 aa  53.1  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  28.85 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  30.28 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  24.08 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2003  uridylate kinase  30.48 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1984  uridylate kinase  30.48 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2049  uridylate kinase  30.48 
 
 		 287 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  24.08 
 
 		 231 aa  50.1  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2220  uridylate kinase  30.84 
 
 		 251 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118147  normal  0.160064 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  28.02 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  27.62 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  21.46 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  28.57 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  28.85 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  22.92 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  28.3 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  28.97 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  32.04 
 
 		 236 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  28.3 
 
 		 248 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0828  uridylate kinase  31.07 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  28.3 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3989  uridylate kinase  29.25 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  27.62 
 
 		 235 aa  46.6  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  26.67 
 
 		 250 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1400  uridylate kinase  29.91 
 
 		 255 aa  46.2  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  29.52 
 
 		 239 aa  46.2  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  28.3 
 
 		 239 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  28.24 
 
 		 236 aa  46.2  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  30.19 
 
 		 239 aa  45.8  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  28.16 
 
 		 236 aa  45.8  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2844  uridylate kinase  27.36 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000917545  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  28.16 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  31.07 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  28.16 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  30.1 
 
 		 238 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2176  uridylate kinase  29.13 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  27.72 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4124  uridylate kinase  28.97 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0482  uridylate kinase  24.12 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4437  uridylate kinase  37.93 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770833 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03235  uridylate kinase  26.97 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4959  uridylate kinase  29.52 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  27.88 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  27.18 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  29.13 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  29.13 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  29.13 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  24.69 
 
 		 236 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  27.18 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0259  uridylate kinase  26.67 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  29.13 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  29.13 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  35 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  29.13 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  29.13 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  29.13 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  28.16 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  27.18 
 
 		 236 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  29.13 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  29.13 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  29.63 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  29.13 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  29.13 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  29.13 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>