96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4783 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4783  methyltransferase FkbM  100 
 
 		 265 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1098  FkbM family methyltransferase  63.67 
 
 		 264 aa  342  2.9999999999999997e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2215  methyltransferase, FkbM family  61.24 
 
 		 264 aa  342  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1869  methyltransferase FkbM family  61.24 
 
 		 264 aa  342  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5295  hypothetical protein  55.38 
 
 		 266 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.090256 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6633  FkbM family methyltransferase  53.88 
 
 		 272 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00015631  hitchhiker  0.000119437 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1251  FkbM family methyltransferase  43.24 
 
 		 262 aa  238  5e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000622553  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5042  FkbM family methyltransferase  29.1 
 
 		 657 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5229  FkbM family methyltransferase  29.1 
 
 		 657 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102005  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3138  methyltransferase FkbM  29.1 
 
 		 657 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0435  FkbM family methyltransferase  27.87 
 
 		 657 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  32.35 
 
 		 723 aa  85.5  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  30.57 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  25.7 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  26.74 
 
 		 415 aa  72.4  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  30.65 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  29.38 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2360  methyltransferase FkbM  26.7 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  25.53 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1244  methyltransferase FkbM  29.07 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  31.21 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  28.26 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  28.45 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  27.81 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  28.28 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  27.98 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  27.27 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  28.51 
 
 		 321 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  27.72 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4304  methyltransferase FkbM family  29.47 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  28.81 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  26.52 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  25.82 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  28.98 
 
 		 1673 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  26.78 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0764  methyltransferase FkbM  26.13 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0124652 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  26.7 
 
 		 386 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  26.7 
 
 		 386 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4823  FkbM family methyltransferase  31.52 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  28.84 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1312  methyltransferase FkbM family  30 
 
 		 286 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1608  methyltransferase FkbM family  25.47 
 
 		 365 aa  52.4  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  26.04 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  32.69 
 
 		 348 aa  52.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  26.94 
 
 		 351 aa  52.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2582  Ata11 protein  27.84 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0553282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  29.05 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  26.59 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  25.34 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  27.35 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1470  FkbM family methyltransferase  23.3 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.684479  normal  0.1078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  25.98 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  25.75 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0453  methyltransferase FkbM family  24.85 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3233  SAM-dependent methyltransferase  27.57 
 
 		 451 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  27.37 
 
 		 792 aa  49.3  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3697  FkbM family methyltransferase  28.33 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191836  normal  0.775464 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2528  methyltransferase FkbM  37.88 
 
 		 738 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3318  methyltransferase  27.03 
 
 		 451 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3281  methyltransferase  27.03 
 
 		 451 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3533  putative methyltransferase  27.03 
 
 		 446 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000121197 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0386  methyltransferase FkbM family  27.42 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3578  methyltransferase  27.03 
 
 		 446 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550916  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2219  methyltransferase FkbM family  26.54 
 
 		 382 aa  48.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0395  methyltransferase FkbM family  27.42 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2405  methyltransferase FkbM  29.26 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00173159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  26.45 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1423  methyltransferase FkbM family  30 
 
 		 739 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  25.42 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  25.82 
 
 		 625 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1321  methyltransferase FkbM family  30 
 
 		 741 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  26.67 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  24.89 
 
 		 661 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1194  methyltransferase FkbM family  26 
 
 		 1498 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.288288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  28.75 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  24.37 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  25.63 
 
 		 283 aa  45.8  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28486  predicted protein  30.38 
 
 		 162 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.617409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  25.91 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  25.71 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5202  FkbM family methyltransferase  26.29 
 
 		 416 aa  45.8  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.327791  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1894  methyltransferase FkbM  24.88 
 
 		 268 aa  45.4  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  25.28 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2361  FkbM family methyltransferase  27.91 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000541582  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  29.89 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  25.42 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  32.77 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1173  methyltransferase FkbM  24.88 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.764759  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0484  FkbM family methyltransferase  27.08 
 
 		 707 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5298  FkbM family methyltransferase  30.43 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1127  putative methyltransferase  42.55 
 
 		 383 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1155  FkbM family methyltransferase  28.49 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0234  hypothetical protein  26.14 
 
 		 275 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160183  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  22.45 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2217  methyltransferase FkbM  27.72 
 
 		 321 aa  42.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1459  methyltransferase FkbM family  25.15 
 
 		 301 aa  42.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>