81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3847 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3847  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  322  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0158  hypothetical protein  84.15 
 
 		 164 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0562  hypothetical protein  43.29 
 
 		 168 aa  124  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2312  hypothetical protein  43.23 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3667  hypothetical protein  34.19 
 
 		 178 aa  91.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290827  normal  0.787143 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3100  hypothetical protein  35.06 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3827  hypothetical protein  35.06 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78759  normal  0.497757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01473  predicted membrane protein i A1501  35 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11150  hypothetical protein  38.53 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  31.85 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  29.93 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  36.7 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  34.62 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  32.67 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  30.22 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  33.01 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0148  hypothetical protein  32.26 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  33.66 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  32.67 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  34.29 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  30.39 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  28.99 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  30.39 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  31.37 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  30.39 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  28.81 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  27.86 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  28.47 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2264  hypothetical protein  36.26 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124319  normal  0.0478819 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  29.93 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  28.06 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  32.67 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  28.37 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  32.67 
 
 		 140 aa  50.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  35.64 
 
 		 140 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  28.67 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  30.82 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  34.65 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  33.67 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  31.63 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  31.69 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  31.63 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  31.63 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  27.46 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  28.28 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  48.1  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  35.79 
 
 		 182 aa  48.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  30.3 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  27.81 
 
 		 194 aa  47.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  27.54 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  30.99 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  32.85 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0001  hypothetical protein  32.5 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000267059  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  29.29 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  30.1 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3572  hypothetical protein  28.57 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  27.46 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0097  hypothetical protein  26.37 
 
 		 144 aa  44.3  0.0008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  30.5 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  28.21 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  36.71 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0384  hypothetical protein  28.17 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0211901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  26.06 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0417  hypothetical protein  29.07 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.260931  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  29 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  30.56 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  31.91 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  26.8 
 
 		 187 aa  42  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  35.29 
 
 		 140 aa  42  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  35.94 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  25 
 
 		 187 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0104  hypothetical protein  25 
 
 		 187 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.805138  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  35.94 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  30.28 
 
 		 178 aa  41.2  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  33.68 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0478  hypothetical protein  31.82 
 
 		 195 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  30.21 
 
 		 142 aa  40.8  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  28 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>