32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3778 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3778  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0222237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1692  hypothetical protein  76.37 
 
 		 347 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1391  hypothetical protein  52.53 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19178  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1516  hypothetical protein  54.06 
 
 		 367 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0503822  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4412  putative exported protein of unknown function  57.84 
 
 		 385 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5498  hypothetical protein  53.48 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0881144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1131  hypothetical protein  46.63 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1003  hypothetical protein  57.32 
 
 		 415 aa  102  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1038  hypothetical protein  57.32 
 
 		 410 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2123  hypothetical protein  50.54 
 
 		 425 aa  99.4  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2832  hypothetical protein  44.23 
 
 		 435 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.135437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2609  hypothetical protein  44.23 
 
 		 433 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256064  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5156  hypothetical protein  45.26 
 
 		 462 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5539  hypothetical protein  46.07 
 
 		 402 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229127  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2465  hypothetical protein  52.38 
 
 		 490 aa  85.9  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.753425  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4636  hypothetical protein  47.67 
 
 		 564 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.113577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2236  hypothetical protein  43.02 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2639  hypothetical protein  47.62 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3528  hypothetical protein  62.5 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0397838 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1985  hypothetical protein  35.23 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.100261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2829  hypothetical protein  37.7 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0854  hypothetical protein  58.33 
 
 		 173 aa  68.9  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.033138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  26.13 
 
 		 3409 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  23.45 
 
 		 3521 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30 
 
 		 1888 aa  55.1  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  25.95 
 
 		 2449 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1526  putative CheA signal transduction histidine kinase  50.54 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1962  hypothetical protein  76.6 
 
 		 355 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173944  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2569  hypothetical protein  39.51 
 
 		 124 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.720897  normal  0.146928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2174  putative FHA domain containing protein  75.51 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00685953  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  26.13 
 
 		 3472 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  26.13 
 
 		 3471 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>